Protein–RNA interactions for Protein: P08226

Apoe, Apolipoprotein E, mousemouse

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ApoeP08226 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ApoeP08226 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ApoeP08226 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ApoeP08226 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ApoeP08226 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ApoeP08226 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ApoeP08226 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ApoeP08226 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ApoeP08226 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ApoeP08226 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ApoeP08226 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ApoeP08226 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ApoeP08226 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ApoeP08226 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ApoeP08226 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ApoeP08226 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ApoeP08226 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ApoeP08226 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ApoeP08226 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
ApoeP08226 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ApoeP08226 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ApoeP08226 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ApoeP08226 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ApoeP08226 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ApoeP08226 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ApoeP08226 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ApoeP08226 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ApoeP08226 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ApoeP08226 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ApoeP08226 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ApoeP08226 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ApoeP08226 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ApoeP08226 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ApoeP08226 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ApoeP08226 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ApoeP08226 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ApoeP08226 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ApoeP08226 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ApoeP08226 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ApoeP08226 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ApoeP08226 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ApoeP08226 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ApoeP08226 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ApoeP08226 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ApoeP08226 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ApoeP08226 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ApoeP08226 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ApoeP08226 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ApoeP08226 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ApoeP08226 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ApoeP08226 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ApoeP08226 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ApoeP08226 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ApoeP08226 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ApoeP08226 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ApoeP08226 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ApoeP08226 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ApoeP08226 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ApoeP08226 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
ApoeP08226 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ApoeP08226 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ApoeP08226 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ApoeP08226 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ApoeP08226 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ApoeP08226 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ApoeP08226 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ApoeP08226 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ApoeP08226 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ApoeP08226 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ApoeP08226 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ApoeP08226 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ApoeP08226 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ApoeP08226 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ApoeP08226 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ApoeP08226 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ApoeP08226 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ApoeP08226 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ApoeP08226 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ApoeP08226 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ApoeP08226 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ApoeP08226 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ApoeP08226 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ApoeP08226 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ApoeP08226 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ApoeP08226 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ApoeP08226 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ApoeP08226 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ApoeP08226 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ApoeP08226 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ApoeP08226 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ApoeP08226 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ApoeP08226 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ApoeP08226 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ApoeP08226 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ApoeP08226 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ApoeP08226 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
ApoeP08226 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
ApoeP08226 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ApoeP08226 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ApoeP08226 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 101.8 ms