Protein–RNA interactions for Protein: P05555

Itgam, Integrin alpha-M, mousemouse

Predictions only

Length 1,153 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ItgamP05555 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ItgamP05555 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
ItgamP05555 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ItgamP05555 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ItgamP05555 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ItgamP05555 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ItgamP05555 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ItgamP05555 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ItgamP05555 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ItgamP05555 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ItgamP05555 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ItgamP05555 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ItgamP05555 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ItgamP05555 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ItgamP05555 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ItgamP05555 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ItgamP05555 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ItgamP05555 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ItgamP05555 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ItgamP05555 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ItgamP05555 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ItgamP05555 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ItgamP05555 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ItgamP05555 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ItgamP05555 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
ItgamP05555 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ItgamP05555 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ItgamP05555 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ItgamP05555 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
ItgamP05555 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ItgamP05555 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ItgamP05555 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ItgamP05555 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ItgamP05555 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ItgamP05555 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ItgamP05555 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ItgamP05555 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
ItgamP05555 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ItgamP05555 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ItgamP05555 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ItgamP05555 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ItgamP05555 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ItgamP05555 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
ItgamP05555 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ItgamP05555 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ItgamP05555 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ItgamP05555 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ItgamP05555 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ItgamP05555 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ItgamP05555 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ItgamP05555 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ItgamP05555 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ItgamP05555 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ItgamP05555 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ItgamP05555 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ItgamP05555 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ItgamP05555 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ItgamP05555 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ItgamP05555 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ItgamP05555 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ItgamP05555 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ItgamP05555 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ItgamP05555 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ItgamP05555 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ItgamP05555 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ItgamP05555 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ItgamP05555 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ItgamP05555 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ItgamP05555 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ItgamP05555 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ItgamP05555 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ItgamP05555 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ItgamP05555 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ItgamP05555 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ItgamP05555 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ItgamP05555 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ItgamP05555 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ItgamP05555 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ItgamP05555 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ItgamP05555 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ItgamP05555 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ItgamP05555 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ItgamP05555 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ItgamP05555 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
ItgamP05555 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ItgamP05555 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ItgamP05555 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ItgamP05555 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
ItgamP05555 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ItgamP05555 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ItgamP05555 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ItgamP05555 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ItgamP05555 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ItgamP05555 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ItgamP05555 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
ItgamP05555 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
ItgamP05555 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ItgamP05555 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ItgamP05555 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ItgamP05555 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.6 ms