Protein–RNA interactions for Protein: P01901

H2-K1, H-2 class I histocompatibility antigen, K-B alpha chain, mousemouse

Predictions only

Length 369 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-K1P01901 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
H2-K1P01901 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
H2-K1P01901 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
H2-K1P01901 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
H2-K1P01901 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
H2-K1P01901 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
H2-K1P01901 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
H2-K1P01901 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
H2-K1P01901 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
H2-K1P01901 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
H2-K1P01901 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
H2-K1P01901 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
H2-K1P01901 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
H2-K1P01901 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
H2-K1P01901 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
H2-K1P01901 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
H2-K1P01901 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
H2-K1P01901 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
H2-K1P01901 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
H2-K1P01901 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
H2-K1P01901 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
H2-K1P01901 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
H2-K1P01901 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
H2-K1P01901 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
H2-K1P01901 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
H2-K1P01901 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
H2-K1P01901 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
H2-K1P01901 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
H2-K1P01901 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
H2-K1P01901 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
H2-K1P01901 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
H2-K1P01901 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
H2-K1P01901 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
H2-K1P01901 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
H2-K1P01901 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
H2-K1P01901 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
H2-K1P01901 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
H2-K1P01901 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
H2-K1P01901 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
H2-K1P01901 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
H2-K1P01901 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
H2-K1P01901 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
H2-K1P01901 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
H2-K1P01901 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
H2-K1P01901 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
H2-K1P01901 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
H2-K1P01901 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
H2-K1P01901 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
H2-K1P01901 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
H2-K1P01901 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
H2-K1P01901 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
H2-K1P01901 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
H2-K1P01901 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
H2-K1P01901 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
H2-K1P01901 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
H2-K1P01901 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
H2-K1P01901 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
H2-K1P01901 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
H2-K1P01901 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
H2-K1P01901 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
H2-K1P01901 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
H2-K1P01901 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
H2-K1P01901 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
H2-K1P01901 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
H2-K1P01901 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
H2-K1P01901 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
H2-K1P01901 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
H2-K1P01901 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
H2-K1P01901 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
H2-K1P01901 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
H2-K1P01901 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
H2-K1P01901 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
H2-K1P01901 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
H2-K1P01901 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
H2-K1P01901 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
H2-K1P01901 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
H2-K1P01901 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
H2-K1P01901 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
H2-K1P01901 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
H2-K1P01901 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
H2-K1P01901 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
H2-K1P01901 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
H2-K1P01901 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
H2-K1P01901 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
H2-K1P01901 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
H2-K1P01901 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
H2-K1P01901 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
H2-K1P01901 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
H2-K1P01901 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
H2-K1P01901 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
H2-K1P01901 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
H2-K1P01901 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
H2-K1P01901 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
H2-K1P01901 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
H2-K1P01901 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
H2-K1P01901 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
H2-K1P01901 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
H2-K1P01901 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
H2-K1P01901 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
H2-K1P01901 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms