Protein–RNA interactions for Protein: P01843

Ig lambda-1 chain C region, mousemouse

Predictions only

Length 105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01843 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
P01843 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
P01843 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
P01843 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
P01843 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
P01843 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
P01843 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
P01843 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
P01843 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
P01843 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
P01843 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
P01843 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
P01843 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
P01843 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
P01843 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
P01843 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
P01843 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
P01843 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
P01843 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
P01843 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
P01843 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
P01843 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
P01843 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
P01843 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
P01843 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
P01843 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
P01843 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
P01843 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
P01843 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
P01843 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
P01843 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
P01843 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
P01843 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
P01843 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
P01843 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
P01843 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
P01843 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
P01843 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
P01843 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
P01843 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
P01843 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
P01843 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
P01843 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
P01843 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01843 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01843 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01843 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01843 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01843 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01843 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01843 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01843 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
P01843 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01843 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01843 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01843 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
P01843 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
P01843 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.18
P01843 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01843 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01843 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01843 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01843 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01843 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01843 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01843 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01843 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01843 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01843 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
P01843 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01843 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01843 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01843 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01843 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01843 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01843 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01843 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01843 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
P01843 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01843 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01843 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01843 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01843 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01843 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01843 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01843 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01843 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01843 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01843 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01843 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01843 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01843 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01843 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01843 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01843 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01843 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01843 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01843 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01843 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01843 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms