Protein–RNA interactions for Protein: O89116

Vti1a, Vesicle transport through interaction with t-SNAREs homolog 1A, mousemouse

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vti1aO89116 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Vti1aO89116 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Vti1aO89116 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Vti1aO89116 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Vti1aO89116 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Vti1aO89116 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Vti1aO89116 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Vti1aO89116 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Vti1aO89116 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Vti1aO89116 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Vti1aO89116 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
Vti1aO89116 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Vti1aO89116 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Vti1aO89116 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Vti1aO89116 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Vti1aO89116 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Vti1aO89116 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Vti1aO89116 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Vti1aO89116 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Vti1aO89116 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Vti1aO89116 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Vti1aO89116 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Vti1aO89116 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Vti1aO89116 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Vti1aO89116 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Vti1aO89116 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Vti1aO89116 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Vti1aO89116 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Vti1aO89116 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Vti1aO89116 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Vti1aO89116 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Vti1aO89116 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Vti1aO89116 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Vti1aO89116 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Vti1aO89116 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Vti1aO89116 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Vti1aO89116 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Vti1aO89116 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Vti1aO89116 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Vti1aO89116 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Vti1aO89116 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Vti1aO89116 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Vti1aO89116 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Vti1aO89116 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Vti1aO89116 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Vti1aO89116 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Vti1aO89116 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Vti1aO89116 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Vti1aO89116 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Vti1aO89116 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Vti1aO89116 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Vti1aO89116 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Vti1aO89116 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Vti1aO89116 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Vti1aO89116 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Vti1aO89116 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Vti1aO89116 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Vti1aO89116 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Vti1aO89116 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Vti1aO89116 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Vti1aO89116 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Vti1aO89116 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Vti1aO89116 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Vti1aO89116 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Vti1aO89116 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Vti1aO89116 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Vti1aO89116 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Vti1aO89116 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Vti1aO89116 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Vti1aO89116 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Vti1aO89116 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Vti1aO89116 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Vti1aO89116 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Vti1aO89116 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Vti1aO89116 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Vti1aO89116 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Vti1aO89116 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Vti1aO89116 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Vti1aO89116 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Vti1aO89116 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Vti1aO89116 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Vti1aO89116 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Vti1aO89116 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Vti1aO89116 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Vti1aO89116 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Vti1aO89116 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Vti1aO89116 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Vti1aO89116 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Vti1aO89116 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Vti1aO89116 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Vti1aO89116 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Vti1aO89116 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Vti1aO89116 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Vti1aO89116 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Vti1aO89116 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Vti1aO89116 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Vti1aO89116 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Vti1aO89116 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Vti1aO89116 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Vti1aO89116 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms