Protein–RNA interactions for Protein: O89116

Vti1a, Vesicle transport through interaction with t-SNAREs homolog 1A, mousemouse

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vti1aO89116 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Vti1aO89116 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Vti1aO89116 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Vti1aO89116 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Vti1aO89116 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Vti1aO89116 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Vti1aO89116 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Vti1aO89116 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Vti1aO89116 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Vti1aO89116 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Vti1aO89116 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
Vti1aO89116 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Vti1aO89116 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Vti1aO89116 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Vti1aO89116 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Vti1aO89116 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Vti1aO89116 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Vti1aO89116 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Vti1aO89116 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Vti1aO89116 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Vti1aO89116 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Vti1aO89116 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Vti1aO89116 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Vti1aO89116 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Vti1aO89116 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Vti1aO89116 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Vti1aO89116 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Vti1aO89116 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Vti1aO89116 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Vti1aO89116 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Vti1aO89116 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Vti1aO89116 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Vti1aO89116 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Vti1aO89116 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Vti1aO89116 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Vti1aO89116 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Vti1aO89116 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Vti1aO89116 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Vti1aO89116 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Vti1aO89116 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Vti1aO89116 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Vti1aO89116 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Vti1aO89116 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Vti1aO89116 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Vti1aO89116 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Vti1aO89116 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Vti1aO89116 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Vti1aO89116 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Vti1aO89116 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Vti1aO89116 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Vti1aO89116 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Vti1aO89116 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Vti1aO89116 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Vti1aO89116 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Vti1aO89116 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Vti1aO89116 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Vti1aO89116 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Vti1aO89116 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Vti1aO89116 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Vti1aO89116 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Vti1aO89116 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Vti1aO89116 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Vti1aO89116 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Vti1aO89116 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Vti1aO89116 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Vti1aO89116 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Vti1aO89116 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Vti1aO89116 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Vti1aO89116 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Vti1aO89116 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Vti1aO89116 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Vti1aO89116 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Vti1aO89116 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Vti1aO89116 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Vti1aO89116 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Vti1aO89116 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Vti1aO89116 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Vti1aO89116 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Vti1aO89116 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Vti1aO89116 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Vti1aO89116 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Vti1aO89116 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Vti1aO89116 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Vti1aO89116 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Vti1aO89116 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Vti1aO89116 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Vti1aO89116 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Vti1aO89116 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Vti1aO89116 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Vti1aO89116 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Vti1aO89116 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Vti1aO89116 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Vti1aO89116 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Vti1aO89116 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Vti1aO89116 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Vti1aO89116 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Vti1aO89116 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Vti1aO89116 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Vti1aO89116 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Vti1aO89116 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.5 ms