Protein–RNA interactions for Protein: O88940

Msc, Musculin, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MscO88940 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
MscO88940 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MscO88940 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
MscO88940 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MscO88940 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
MscO88940 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
MscO88940 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
MscO88940 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MscO88940 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
MscO88940 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MscO88940 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
MscO88940 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MscO88940 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MscO88940 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MscO88940 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MscO88940 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MscO88940 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MscO88940 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MscO88940 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MscO88940 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MscO88940 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MscO88940 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MscO88940 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MscO88940 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MscO88940 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MscO88940 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MscO88940 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MscO88940 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MscO88940 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
MscO88940 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
MscO88940 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
MscO88940 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
MscO88940 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MscO88940 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
MscO88940 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MscO88940 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MscO88940 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MscO88940 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MscO88940 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MscO88940 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MscO88940 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MscO88940 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MscO88940 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MscO88940 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MscO88940 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MscO88940 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MscO88940 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MscO88940 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MscO88940 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MscO88940 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
MscO88940 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
MscO88940 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
MscO88940 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC21.32■■□□□ 1
MscO88940 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MscO88940 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
MscO88940 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MscO88940 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MscO88940 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MscO88940 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MscO88940 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MscO88940 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MscO88940 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MscO88940 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
MscO88940 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MscO88940 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
MscO88940 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
MscO88940 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
MscO88940 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC21.27■■□□□ 1
MscO88940 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MscO88940 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MscO88940 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
MscO88940 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
MscO88940 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
MscO88940 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
MscO88940 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
MscO88940 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MscO88940 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MscO88940 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MscO88940 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
MscO88940 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
MscO88940 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
MscO88940 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
MscO88940 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
MscO88940 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
MscO88940 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
MscO88940 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
MscO88940 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
MscO88940 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
MscO88940 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
MscO88940 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
MscO88940 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
MscO88940 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
MscO88940 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
MscO88940 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
MscO88940 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
MscO88940 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
MscO88940 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
MscO88940 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
MscO88940 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
MscO88940 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.8 ms