Protein–RNA interactions for Protein: O88466

Znf106, Zinc finger protein 106, mousemouse

Predictions only

Length 1,888 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf106O88466 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Znf106O88466 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Znf106O88466 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Znf106O88466 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Znf106O88466 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Znf106O88466 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Znf106O88466 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Znf106O88466 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Znf106O88466 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Znf106O88466 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Znf106O88466 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Znf106O88466 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Znf106O88466 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Znf106O88466 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Znf106O88466 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Znf106O88466 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Znf106O88466 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Znf106O88466 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Znf106O88466 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Znf106O88466 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Znf106O88466 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Znf106O88466 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Znf106O88466 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Znf106O88466 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Znf106O88466 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Znf106O88466 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Znf106O88466 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Znf106O88466 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Znf106O88466 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Znf106O88466 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Znf106O88466 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Znf106O88466 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Znf106O88466 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Znf106O88466 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Znf106O88466 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Znf106O88466 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Znf106O88466 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Znf106O88466 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Znf106O88466 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Znf106O88466 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Znf106O88466 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Znf106O88466 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Znf106O88466 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Znf106O88466 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Znf106O88466 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Znf106O88466 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Znf106O88466 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Znf106O88466 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Znf106O88466 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Znf106O88466 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Znf106O88466 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Znf106O88466 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Znf106O88466 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Znf106O88466 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Znf106O88466 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Znf106O88466 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Znf106O88466 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Znf106O88466 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Znf106O88466 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Znf106O88466 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Znf106O88466 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Znf106O88466 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Znf106O88466 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Znf106O88466 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Znf106O88466 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Znf106O88466 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Znf106O88466 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Znf106O88466 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Znf106O88466 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Znf106O88466 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Znf106O88466 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Znf106O88466 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Znf106O88466 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Znf106O88466 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Znf106O88466 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Znf106O88466 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Znf106O88466 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Znf106O88466 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Znf106O88466 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Znf106O88466 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Znf106O88466 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Znf106O88466 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Znf106O88466 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Znf106O88466 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Znf106O88466 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Znf106O88466 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.47
Znf106O88466 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Znf106O88466 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Znf106O88466 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Znf106O88466 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Znf106O88466 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Znf106O88466 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Znf106O88466 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Znf106O88466 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Znf106O88466 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Znf106O88466 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Znf106O88466 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Znf106O88466 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Znf106O88466 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Znf106O88466 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms