Protein–RNA interactions for Protein: O70435

Psma3, Proteasome subunit alpha type-3, mousemouse

Predictions only

Length 255 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psma3O70435 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Psma3O70435 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Psma3O70435 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Psma3O70435 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Psma3O70435 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Psma3O70435 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Psma3O70435 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Psma3O70435 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Psma3O70435 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Psma3O70435 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Psma3O70435 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Psma3O70435 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Psma3O70435 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Psma3O70435 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Psma3O70435 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Psma3O70435 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Psma3O70435 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Psma3O70435 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Psma3O70435 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Psma3O70435 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Psma3O70435 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Psma3O70435 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Psma3O70435 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Psma3O70435 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Psma3O70435 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Psma3O70435 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Psma3O70435 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Psma3O70435 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Psma3O70435 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Psma3O70435 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Psma3O70435 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Psma3O70435 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Psma3O70435 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Psma3O70435 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Psma3O70435 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Psma3O70435 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Psma3O70435 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Psma3O70435 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Psma3O70435 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Psma3O70435 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Psma3O70435 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Psma3O70435 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Psma3O70435 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Psma3O70435 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Psma3O70435 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Psma3O70435 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Psma3O70435 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Psma3O70435 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Psma3O70435 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Psma3O70435 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Psma3O70435 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Psma3O70435 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Psma3O70435 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Psma3O70435 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Psma3O70435 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Psma3O70435 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Psma3O70435 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Psma3O70435 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Psma3O70435 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Psma3O70435 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Psma3O70435 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Psma3O70435 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Psma3O70435 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Psma3O70435 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Psma3O70435 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Psma3O70435 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Psma3O70435 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Psma3O70435 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Psma3O70435 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Psma3O70435 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Psma3O70435 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Psma3O70435 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Psma3O70435 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Psma3O70435 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Psma3O70435 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Psma3O70435 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Psma3O70435 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Psma3O70435 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Psma3O70435 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Psma3O70435 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Psma3O70435 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Psma3O70435 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Psma3O70435 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Psma3O70435 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Psma3O70435 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Psma3O70435 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Psma3O70435 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Psma3O70435 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Psma3O70435 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Psma3O70435 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Psma3O70435 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Psma3O70435 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Psma3O70435 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Psma3O70435 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Psma3O70435 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Psma3O70435 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Psma3O70435 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Psma3O70435 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Psma3O70435 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Psma3O70435 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10 ms