Protein–RNA interactions for Protein: O55226

Chad, Chondroadherin, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChadO55226 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ChadO55226 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
ChadO55226 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ChadO55226 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ChadO55226 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
ChadO55226 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ChadO55226 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
ChadO55226 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ChadO55226 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ChadO55226 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC24■■□□□ 1.43
ChadO55226 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC24■■□□□ 1.43
ChadO55226 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
ChadO55226 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC24■■□□□ 1.43
ChadO55226 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ChadO55226 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC24■■□□□ 1.43
ChadO55226 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC24■■□□□ 1.43
ChadO55226 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ChadO55226 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ChadO55226 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
ChadO55226 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ChadO55226 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ChadO55226 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ChadO55226 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ChadO55226 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ChadO55226 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
ChadO55226 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ChadO55226 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ChadO55226 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ChadO55226 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ChadO55226 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ChadO55226 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ChadO55226 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ChadO55226 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ChadO55226 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ChadO55226 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ChadO55226 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ChadO55226 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ChadO55226 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
ChadO55226 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ChadO55226 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ChadO55226 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ChadO55226 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ChadO55226 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ChadO55226 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ChadO55226 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ChadO55226 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
ChadO55226 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ChadO55226 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ChadO55226 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ChadO55226 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ChadO55226 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ChadO55226 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ChadO55226 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
ChadO55226 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ChadO55226 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ChadO55226 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ChadO55226 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ChadO55226 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ChadO55226 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ChadO55226 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ChadO55226 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ChadO55226 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ChadO55226 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ChadO55226 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ChadO55226 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ChadO55226 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
ChadO55226 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ChadO55226 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ChadO55226 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
ChadO55226 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ChadO55226 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
ChadO55226 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ChadO55226 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ChadO55226 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ChadO55226 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ChadO55226 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ChadO55226 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ChadO55226 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ChadO55226 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ChadO55226 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
ChadO55226 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ChadO55226 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ChadO55226 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
ChadO55226 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
ChadO55226 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ChadO55226 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ChadO55226 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ChadO55226 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ChadO55226 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
ChadO55226 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ChadO55226 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ChadO55226 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ChadO55226 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ChadO55226 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ChadO55226 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ChadO55226 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ChadO55226 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
ChadO55226 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ChadO55226 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
ChadO55226 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.3 ms