Protein–RNA interactions for Protein: O55222

Ilk, Integrin-linked protein kinase, mousemouse

Predictions only

Length 452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IlkO55222 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
IlkO55222 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
IlkO55222 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
IlkO55222 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
IlkO55222 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
IlkO55222 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
IlkO55222 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
IlkO55222 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
IlkO55222 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
IlkO55222 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
IlkO55222 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
IlkO55222 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
IlkO55222 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
IlkO55222 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
IlkO55222 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
IlkO55222 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
IlkO55222 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
IlkO55222 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
IlkO55222 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
IlkO55222 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
IlkO55222 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
IlkO55222 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
IlkO55222 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
IlkO55222 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
IlkO55222 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
IlkO55222 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
IlkO55222 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
IlkO55222 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
IlkO55222 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
IlkO55222 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
IlkO55222 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
IlkO55222 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
IlkO55222 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
IlkO55222 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
IlkO55222 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
IlkO55222 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
IlkO55222 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
IlkO55222 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
IlkO55222 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
IlkO55222 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
IlkO55222 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
IlkO55222 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
IlkO55222 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
IlkO55222 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
IlkO55222 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
IlkO55222 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
IlkO55222 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
IlkO55222 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
IlkO55222 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
IlkO55222 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
IlkO55222 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
IlkO55222 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
IlkO55222 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
IlkO55222 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
IlkO55222 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
IlkO55222 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
IlkO55222 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
IlkO55222 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
IlkO55222 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
IlkO55222 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
IlkO55222 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
IlkO55222 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
IlkO55222 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
IlkO55222 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
IlkO55222 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
IlkO55222 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
IlkO55222 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
IlkO55222 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
IlkO55222 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
IlkO55222 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
IlkO55222 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
IlkO55222 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
IlkO55222 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
IlkO55222 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
IlkO55222 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
IlkO55222 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
IlkO55222 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
IlkO55222 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
IlkO55222 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
IlkO55222 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
IlkO55222 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
IlkO55222 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
IlkO55222 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
IlkO55222 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
IlkO55222 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
IlkO55222 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
IlkO55222 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
IlkO55222 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
IlkO55222 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
IlkO55222 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
IlkO55222 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
IlkO55222 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
IlkO55222 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
IlkO55222 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
IlkO55222 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
IlkO55222 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
IlkO55222 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
IlkO55222 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
IlkO55222 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
IlkO55222 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 96.6 ms