Protein–RNA interactions for Protein: O55033

Nck2, Cytoplasmic protein NCK2, mousemouse

Predictions only

Length 380 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nck2O55033 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Nck2O55033 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Nck2O55033 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Nck2O55033 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Nck2O55033 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Nck2O55033 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
Nck2O55033 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Nck2O55033 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
Nck2O55033 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Nck2O55033 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Nck2O55033 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Nck2O55033 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Nck2O55033 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Nck2O55033 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Nck2O55033 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Nck2O55033 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Nck2O55033 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Nck2O55033 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Nck2O55033 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Nck2O55033 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Nck2O55033 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Nck2O55033 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Nck2O55033 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Nck2O55033 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Nck2O55033 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Nck2O55033 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Nck2O55033 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Nck2O55033 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Nck2O55033 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Nck2O55033 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.92
Nck2O55033 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Nck2O55033 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Nck2O55033 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
Nck2O55033 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Nck2O55033 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Nck2O55033 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Nck2O55033 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Nck2O55033 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
Nck2O55033 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
Nck2O55033 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Nck2O55033 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Nck2O55033 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Nck2O55033 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Nck2O55033 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
Nck2O55033 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Nck2O55033 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Nck2O55033 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Nck2O55033 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Nck2O55033 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Nck2O55033 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Nck2O55033 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
Nck2O55033 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Nck2O55033 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Nck2O55033 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Nck2O55033 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Nck2O55033 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC27■■□□□ 1.91
Nck2O55033 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Nck2O55033 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Nck2O55033 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Nck2O55033 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Nck2O55033 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Nck2O55033 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
Nck2O55033 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Nck2O55033 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Nck2O55033 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Nck2O55033 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Nck2O55033 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Nck2O55033 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
Nck2O55033 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
Nck2O55033 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Nck2O55033 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Nck2O55033 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Nck2O55033 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Nck2O55033 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Nck2O55033 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Nck2O55033 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Nck2O55033 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Nck2O55033 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Nck2O55033 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Nck2O55033 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Nck2O55033 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Nck2O55033 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Nck2O55033 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Nck2O55033 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Nck2O55033 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Nck2O55033 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Nck2O55033 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Nck2O55033 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Nck2O55033 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Nck2O55033 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Nck2O55033 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Nck2O55033 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
Nck2O55033 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Nck2O55033 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Nck2O55033 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Nck2O55033 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Nck2O55033 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Nck2O55033 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Nck2O55033 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Nck2O55033 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms