Protein–RNA interactions for Protein: O54956

Pole2, DNA polymerase epsilon subunit 2, mousemouse

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pole2O54956 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pole2O54956 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pole2O54956 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pole2O54956 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pole2O54956 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pole2O54956 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pole2O54956 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pole2O54956 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pole2O54956 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pole2O54956 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pole2O54956 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pole2O54956 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pole2O54956 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pole2O54956 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Pole2O54956 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pole2O54956 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pole2O54956 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pole2O54956 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pole2O54956 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Pole2O54956 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pole2O54956 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pole2O54956 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pole2O54956 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pole2O54956 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pole2O54956 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pole2O54956 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pole2O54956 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pole2O54956 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pole2O54956 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pole2O54956 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pole2O54956 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pole2O54956 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pole2O54956 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pole2O54956 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pole2O54956 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pole2O54956 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pole2O54956 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pole2O54956 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pole2O54956 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pole2O54956 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pole2O54956 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pole2O54956 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pole2O54956 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pole2O54956 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pole2O54956 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Pole2O54956 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Pole2O54956 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Pole2O54956 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pole2O54956 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pole2O54956 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pole2O54956 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pole2O54956 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pole2O54956 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pole2O54956 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pole2O54956 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pole2O54956 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pole2O54956 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pole2O54956 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pole2O54956 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pole2O54956 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pole2O54956 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Pole2O54956 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Pole2O54956 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Pole2O54956 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pole2O54956 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pole2O54956 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pole2O54956 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pole2O54956 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pole2O54956 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pole2O54956 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Pole2O54956 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pole2O54956 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pole2O54956 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pole2O54956 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pole2O54956 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pole2O54956 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pole2O54956 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pole2O54956 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pole2O54956 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pole2O54956 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Pole2O54956 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Pole2O54956 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Pole2O54956 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Pole2O54956 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Pole2O54956 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Pole2O54956 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Pole2O54956 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Pole2O54956 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Pole2O54956 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Pole2O54956 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Pole2O54956 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Pole2O54956 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pole2O54956 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pole2O54956 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pole2O54956 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pole2O54956 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pole2O54956 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pole2O54956 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pole2O54956 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Pole2O54956 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 118.5 ms