Protein–RNA interactions for Protein: O54891

Lgals6, Galectin-6, mousemouse

Predictions only

Length 301 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lgals6O54891 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Lgals6O54891 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Lgals6O54891 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Lgals6O54891 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Lgals6O54891 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Lgals6O54891 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Lgals6O54891 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Lgals6O54891 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Lgals6O54891 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Lgals6O54891 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Lgals6O54891 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Lgals6O54891 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Lgals6O54891 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Lgals6O54891 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Lgals6O54891 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Lgals6O54891 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Lgals6O54891 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Lgals6O54891 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Lgals6O54891 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Lgals6O54891 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Lgals6O54891 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Lgals6O54891 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Lgals6O54891 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Lgals6O54891 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lgals6O54891 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lgals6O54891 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lgals6O54891 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lgals6O54891 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lgals6O54891 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Lgals6O54891 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lgals6O54891 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lgals6O54891 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lgals6O54891 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lgals6O54891 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lgals6O54891 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lgals6O54891 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lgals6O54891 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lgals6O54891 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lgals6O54891 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lgals6O54891 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lgals6O54891 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lgals6O54891 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lgals6O54891 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lgals6O54891 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Lgals6O54891 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lgals6O54891 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lgals6O54891 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lgals6O54891 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lgals6O54891 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lgals6O54891 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Lgals6O54891 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Lgals6O54891 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Lgals6O54891 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Lgals6O54891 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Lgals6O54891 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Lgals6O54891 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Lgals6O54891 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lgals6O54891 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lgals6O54891 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lgals6O54891 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lgals6O54891 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lgals6O54891 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lgals6O54891 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lgals6O54891 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Lgals6O54891 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Lgals6O54891 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Lgals6O54891 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Lgals6O54891 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Lgals6O54891 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Lgals6O54891 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Lgals6O54891 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Lgals6O54891 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Lgals6O54891 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Lgals6O54891 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Lgals6O54891 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Lgals6O54891 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Lgals6O54891 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Lgals6O54891 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Lgals6O54891 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Lgals6O54891 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Lgals6O54891 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Lgals6O54891 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Lgals6O54891 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Lgals6O54891 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Lgals6O54891 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Lgals6O54891 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Lgals6O54891 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Lgals6O54891 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Lgals6O54891 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Lgals6O54891 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Lgals6O54891 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Lgals6O54891 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Lgals6O54891 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Lgals6O54891 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Lgals6O54891 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Lgals6O54891 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Lgals6O54891 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Lgals6O54891 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Lgals6O54891 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Lgals6O54891 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms