Protein–RNA interactions for Protein: O54693

Eda, Ectodysplasin-A, mousemouse

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EdaO54693 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
EdaO54693 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
EdaO54693 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
EdaO54693 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
EdaO54693 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
EdaO54693 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
EdaO54693 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
EdaO54693 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
EdaO54693 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
EdaO54693 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
EdaO54693 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
EdaO54693 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
EdaO54693 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
EdaO54693 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
EdaO54693 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
EdaO54693 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
EdaO54693 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
EdaO54693 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
EdaO54693 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
EdaO54693 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
EdaO54693 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
EdaO54693 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
EdaO54693 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
EdaO54693 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
EdaO54693 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
EdaO54693 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
EdaO54693 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
EdaO54693 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
EdaO54693 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
EdaO54693 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
EdaO54693 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
EdaO54693 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
EdaO54693 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
EdaO54693 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
EdaO54693 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
EdaO54693 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
EdaO54693 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
EdaO54693 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
EdaO54693 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
EdaO54693 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
EdaO54693 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
EdaO54693 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
EdaO54693 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
EdaO54693 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
EdaO54693 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
EdaO54693 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
EdaO54693 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
EdaO54693 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
EdaO54693 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
EdaO54693 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
EdaO54693 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
EdaO54693 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
EdaO54693 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
EdaO54693 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
EdaO54693 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
EdaO54693 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
EdaO54693 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
EdaO54693 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
EdaO54693 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
EdaO54693 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
EdaO54693 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
EdaO54693 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
EdaO54693 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
EdaO54693 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
EdaO54693 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
EdaO54693 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
EdaO54693 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
EdaO54693 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
EdaO54693 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
EdaO54693 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
EdaO54693 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
EdaO54693 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
EdaO54693 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
EdaO54693 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
EdaO54693 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
EdaO54693 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
EdaO54693 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
EdaO54693 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
EdaO54693 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
EdaO54693 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
EdaO54693 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
EdaO54693 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
EdaO54693 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
EdaO54693 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
EdaO54693 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
EdaO54693 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
EdaO54693 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
EdaO54693 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
EdaO54693 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
EdaO54693 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
EdaO54693 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
EdaO54693 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
EdaO54693 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
EdaO54693 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
EdaO54693 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
EdaO54693 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
EdaO54693 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
EdaO54693 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
EdaO54693 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
EdaO54693 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.6 ms