Protein–RNA interactions for Protein: O35544

Slc1a6, Excitatory amino acid transporter 4, mousemouse

Predictions only

Length 561 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc1a6O35544 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Slc1a6O35544 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Slc1a6O35544 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Slc1a6O35544 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Slc1a6O35544 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Slc1a6O35544 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Slc1a6O35544 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Slc1a6O35544 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Slc1a6O35544 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Slc1a6O35544 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Slc1a6O35544 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Slc1a6O35544 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Slc1a6O35544 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Slc1a6O35544 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Slc1a6O35544 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Slc1a6O35544 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Slc1a6O35544 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Slc1a6O35544 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Slc1a6O35544 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Slc1a6O35544 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Slc1a6O35544 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Slc1a6O35544 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Slc1a6O35544 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Slc1a6O35544 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Slc1a6O35544 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Slc1a6O35544 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Slc1a6O35544 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Slc1a6O35544 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Slc1a6O35544 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Slc1a6O35544 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Slc1a6O35544 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Slc1a6O35544 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Slc1a6O35544 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Slc1a6O35544 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Slc1a6O35544 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Slc1a6O35544 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Slc1a6O35544 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Slc1a6O35544 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Slc1a6O35544 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Slc1a6O35544 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Slc1a6O35544 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Slc1a6O35544 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Slc1a6O35544 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Slc1a6O35544 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Slc1a6O35544 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Slc1a6O35544 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Slc1a6O35544 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Slc1a6O35544 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Slc1a6O35544 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Slc1a6O35544 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Slc1a6O35544 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Slc1a6O35544 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Slc1a6O35544 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Slc1a6O35544 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Slc1a6O35544 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Slc1a6O35544 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Slc1a6O35544 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Slc1a6O35544 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Slc1a6O35544 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Slc1a6O35544 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Slc1a6O35544 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Slc1a6O35544 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Slc1a6O35544 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Slc1a6O35544 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Slc1a6O35544 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Slc1a6O35544 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Slc1a6O35544 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Slc1a6O35544 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Slc1a6O35544 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Slc1a6O35544 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Slc1a6O35544 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Slc1a6O35544 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Slc1a6O35544 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Slc1a6O35544 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Slc1a6O35544 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Slc1a6O35544 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Slc1a6O35544 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Slc1a6O35544 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Slc1a6O35544 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Slc1a6O35544 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Slc1a6O35544 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Slc1a6O35544 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Slc1a6O35544 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Slc1a6O35544 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Slc1a6O35544 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Slc1a6O35544 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Slc1a6O35544 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Slc1a6O35544 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Slc1a6O35544 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Slc1a6O35544 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Slc1a6O35544 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Slc1a6O35544 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Slc1a6O35544 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Slc1a6O35544 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Slc1a6O35544 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Slc1a6O35544 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Slc1a6O35544 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Slc1a6O35544 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Slc1a6O35544 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Slc1a6O35544 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.6 ms