Protein–RNA interactions for Protein: O35464

Sema6a, Semaphorin-6A, mousemouse

Predictions only

Length 1,031 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema6aO35464 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sema6aO35464 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sema6aO35464 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sema6aO35464 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sema6aO35464 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sema6aO35464 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sema6aO35464 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sema6aO35464 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sema6aO35464 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sema6aO35464 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sema6aO35464 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sema6aO35464 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Sema6aO35464 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sema6aO35464 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sema6aO35464 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sema6aO35464 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sema6aO35464 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sema6aO35464 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sema6aO35464 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Sema6aO35464 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sema6aO35464 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sema6aO35464 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sema6aO35464 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sema6aO35464 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sema6aO35464 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sema6aO35464 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sema6aO35464 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sema6aO35464 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sema6aO35464 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sema6aO35464 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sema6aO35464 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sema6aO35464 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sema6aO35464 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sema6aO35464 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sema6aO35464 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sema6aO35464 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sema6aO35464 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sema6aO35464 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sema6aO35464 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sema6aO35464 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sema6aO35464 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sema6aO35464 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sema6aO35464 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sema6aO35464 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sema6aO35464 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sema6aO35464 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sema6aO35464 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sema6aO35464 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sema6aO35464 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Sema6aO35464 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sema6aO35464 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sema6aO35464 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sema6aO35464 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sema6aO35464 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sema6aO35464 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Sema6aO35464 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sema6aO35464 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sema6aO35464 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sema6aO35464 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sema6aO35464 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sema6aO35464 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sema6aO35464 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sema6aO35464 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sema6aO35464 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Sema6aO35464 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sema6aO35464 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sema6aO35464 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sema6aO35464 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sema6aO35464 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sema6aO35464 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sema6aO35464 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sema6aO35464 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sema6aO35464 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sema6aO35464 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sema6aO35464 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sema6aO35464 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sema6aO35464 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sema6aO35464 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sema6aO35464 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sema6aO35464 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sema6aO35464 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sema6aO35464 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sema6aO35464 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sema6aO35464 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sema6aO35464 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sema6aO35464 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sema6aO35464 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sema6aO35464 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sema6aO35464 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sema6aO35464 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sema6aO35464 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sema6aO35464 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sema6aO35464 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sema6aO35464 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sema6aO35464 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sema6aO35464 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sema6aO35464 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sema6aO35464 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sema6aO35464 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sema6aO35464 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.6 ms