Protein–RNA interactions for Protein: O35448

Ppt2, Lysosomal thioesterase PPT2, mousemouse

Predictions only

Length 302 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppt2O35448 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ppt2O35448 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ppt2O35448 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ppt2O35448 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ppt2O35448 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ppt2O35448 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ppt2O35448 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ppt2O35448 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Ppt2O35448 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ppt2O35448 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ppt2O35448 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ppt2O35448 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ppt2O35448 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ppt2O35448 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ppt2O35448 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ppt2O35448 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ppt2O35448 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Ppt2O35448 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Ppt2O35448 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ppt2O35448 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ppt2O35448 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ppt2O35448 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ppt2O35448 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ppt2O35448 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ppt2O35448 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ppt2O35448 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ppt2O35448 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ppt2O35448 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Ppt2O35448 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Ppt2O35448 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ppt2O35448 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ppt2O35448 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ppt2O35448 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ppt2O35448 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Ppt2O35448 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ppt2O35448 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ppt2O35448 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ppt2O35448 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ppt2O35448 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ppt2O35448 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ppt2O35448 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ppt2O35448 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ppt2O35448 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ppt2O35448 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ppt2O35448 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ppt2O35448 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ppt2O35448 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ppt2O35448 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ppt2O35448 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Ppt2O35448 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ppt2O35448 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ppt2O35448 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ppt2O35448 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ppt2O35448 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ppt2O35448 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ppt2O35448 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ppt2O35448 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ppt2O35448 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ppt2O35448 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ppt2O35448 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ppt2O35448 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ppt2O35448 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Ppt2O35448 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ppt2O35448 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ppt2O35448 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Ppt2O35448 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Ppt2O35448 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Ppt2O35448 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ppt2O35448 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ppt2O35448 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ppt2O35448 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ppt2O35448 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ppt2O35448 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ppt2O35448 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ppt2O35448 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ppt2O35448 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ppt2O35448 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ppt2O35448 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ppt2O35448 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ppt2O35448 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Ppt2O35448 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ppt2O35448 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ppt2O35448 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ppt2O35448 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ppt2O35448 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ppt2O35448 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ppt2O35448 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ppt2O35448 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ppt2O35448 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ppt2O35448 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ppt2O35448 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ppt2O35448 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ppt2O35448 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ppt2O35448 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ppt2O35448 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ppt2O35448 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ppt2O35448 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ppt2O35448 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ppt2O35448 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ppt2O35448 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms