Protein–RNA interactions for Protein: O35324

Sh2d1b, SH2 domain-containing protein 1B, mousemouse

Predictions only

Length 132 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh2d1bO35324 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Sh2d1bO35324 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Sh2d1bO35324 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sh2d1bO35324 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sh2d1bO35324 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sh2d1bO35324 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sh2d1bO35324 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sh2d1bO35324 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sh2d1bO35324 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sh2d1bO35324 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sh2d1bO35324 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sh2d1bO35324 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sh2d1bO35324 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sh2d1bO35324 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sh2d1bO35324 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sh2d1bO35324 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sh2d1bO35324 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Sh2d1bO35324 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Sh2d1bO35324 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sh2d1bO35324 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sh2d1bO35324 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sh2d1bO35324 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sh2d1bO35324 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sh2d1bO35324 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sh2d1bO35324 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sh2d1bO35324 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sh2d1bO35324 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Sh2d1bO35324 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sh2d1bO35324 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
Sh2d1bO35324 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sh2d1bO35324 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sh2d1bO35324 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sh2d1bO35324 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sh2d1bO35324 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sh2d1bO35324 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sh2d1bO35324 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sh2d1bO35324 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sh2d1bO35324 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sh2d1bO35324 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Sh2d1bO35324 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sh2d1bO35324 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Sh2d1bO35324 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sh2d1bO35324 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sh2d1bO35324 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sh2d1bO35324 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sh2d1bO35324 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sh2d1bO35324 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sh2d1bO35324 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Sh2d1bO35324 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sh2d1bO35324 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sh2d1bO35324 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sh2d1bO35324 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sh2d1bO35324 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Sh2d1bO35324 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Sh2d1bO35324 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sh2d1bO35324 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sh2d1bO35324 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sh2d1bO35324 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sh2d1bO35324 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sh2d1bO35324 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sh2d1bO35324 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sh2d1bO35324 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Sh2d1bO35324 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sh2d1bO35324 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sh2d1bO35324 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sh2d1bO35324 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sh2d1bO35324 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sh2d1bO35324 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sh2d1bO35324 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Sh2d1bO35324 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sh2d1bO35324 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sh2d1bO35324 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sh2d1bO35324 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sh2d1bO35324 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sh2d1bO35324 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Sh2d1bO35324 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sh2d1bO35324 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sh2d1bO35324 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sh2d1bO35324 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Sh2d1bO35324 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sh2d1bO35324 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sh2d1bO35324 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sh2d1bO35324 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sh2d1bO35324 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sh2d1bO35324 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sh2d1bO35324 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sh2d1bO35324 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Sh2d1bO35324 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sh2d1bO35324 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Sh2d1bO35324 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sh2d1bO35324 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sh2d1bO35324 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sh2d1bO35324 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sh2d1bO35324 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Sh2d1bO35324 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Sh2d1bO35324 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Sh2d1bO35324 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sh2d1bO35324 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sh2d1bO35324 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sh2d1bO35324 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.7 ms