Protein–RNA interactions for Protein: O35160

Pitx3, Pituitary homeobox 3, mousemouse

Predictions only

Length 302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pitx3O35160 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19,22■□□□□ 0,67
Pitx3O35160 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,22■□□□□ 0,67
Pitx3O35160 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,22■□□□□ 0,67
Pitx3O35160 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC19,21■□□□□ 0,67
Pitx3O35160 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC19,21■□□□□ 0,67
Pitx3O35160 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC19,21■□□□□ 0,67
Pitx3O35160 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,21■□□□□ 0,67
Pitx3O35160 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC19,2■□□□□ 0,66
Pitx3O35160 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,2■□□□□ 0,66
Pitx3O35160 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19,2■□□□□ 0,66
Pitx3O35160 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19,2■□□□□ 0,66
Pitx3O35160 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,19■□□□□ 0,66
Pitx3O35160 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,19■□□□□ 0,66
Pitx3O35160 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,19■□□□□ 0,66
Pitx3O35160 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19,19■□□□□ 0,66
Pitx3O35160 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,18■□□□□ 0,66
Pitx3O35160 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC19,18■□□□□ 0,66
Pitx3O35160 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,18■□□□□ 0,66
Pitx3O35160 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,18■□□□□ 0,66
Pitx3O35160 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,17■□□□□ 0,66
Pitx3O35160 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,17■□□□□ 0,66
Pitx3O35160 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,17■□□□□ 0,66
Pitx3O35160 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19,17■□□□□ 0,66
Pitx3O35160 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,17■□□□□ 0,66
Pitx3O35160 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19,16■□□□□ 0,66
Pitx3O35160 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC19,16■□□□□ 0,66
Pitx3O35160 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC19,16■□□□□ 0,66
Pitx3O35160 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC19,15■□□□□ 0,66
Pitx3O35160 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19,15■□□□□ 0,66
Pitx3O35160 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19,15■□□□□ 0,66
Pitx3O35160 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19,15■□□□□ 0,66
Pitx3O35160 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC19,15■□□□□ 0,66
Pitx3O35160 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC19,15■□□□□ 0,66
Pitx3O35160 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC19,15■□□□□ 0,66
Pitx3O35160 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,15■□□□□ 0,66
Pitx3O35160 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,15■□□□□ 0,66
Pitx3O35160 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,15■□□□□ 0,66
Pitx3O35160 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19,15■□□□□ 0,66
Pitx3O35160 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19,15■□□□□ 0,66
Pitx3O35160 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19,14■□□□□ 0,65
Pitx3O35160 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,14■□□□□ 0,65
Pitx3O35160 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC19,14■□□□□ 0,65
Pitx3O35160 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,14■□□□□ 0,65
Pitx3O35160 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19,14■□□□□ 0,65
Pitx3O35160 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC19,13■□□□□ 0,65
Pitx3O35160 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,13■□□□□ 0,65
Pitx3O35160 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC19,13■□□□□ 0,65
Pitx3O35160 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,13■□□□□ 0,65
Pitx3O35160 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19,13■□□□□ 0,65
Pitx3O35160 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC19,13■□□□□ 0,65
Pitx3O35160 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC19,13■□□□□ 0,65
Pitx3O35160 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC19,13■□□□□ 0,65
Pitx3O35160 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19,12■□□□□ 0,65
Pitx3O35160 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,12■□□□□ 0,65
Pitx3O35160 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC19,12■□□□□ 0,65
Pitx3O35160 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC19,12■□□□□ 0,65
Pitx3O35160 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19,12■□□□□ 0,65
Pitx3O35160 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19,12■□□□□ 0,65
Pitx3O35160 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19,12■□□□□ 0,65
Pitx3O35160 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,11■□□□□ 0,65
Pitx3O35160 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,11■□□□□ 0,65
Pitx3O35160 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,11■□□□□ 0,65
Pitx3O35160 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,11■□□□□ 0,65
Pitx3O35160 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC19,11■□□□□ 0,65
Pitx3O35160 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,11■□□□□ 0,65
Pitx3O35160 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC19,1■□□□□ 0,65
Pitx3O35160 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19,1■□□□□ 0,65
Pitx3O35160 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC19,09■□□□□ 0,65
Pitx3O35160 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC19,09■□□□□ 0,65
Pitx3O35160 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19,09■□□□□ 0,65
Pitx3O35160 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC19,09■□□□□ 0,65
Pitx3O35160 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19,09■□□□□ 0,65
Pitx3O35160 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,09■□□□□ 0,65
Pitx3O35160 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,08■□□□□ 0,65
Pitx3O35160 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19,08■□□□□ 0,65
Pitx3O35160 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19,08■□□□□ 0,64
Pitx3O35160 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC19,07■□□□□ 0,64
Pitx3O35160 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19,07■□□□□ 0,64
Pitx3O35160 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,07■□□□□ 0,64
Pitx3O35160 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC19,07■□□□□ 0,64
Pitx3O35160 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,07■□□□□ 0,64
Pitx3O35160 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,06■□□□□ 0,64
Pitx3O35160 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19,06■□□□□ 0,64
Pitx3O35160 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,06■□□□□ 0,64
Pitx3O35160 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19,06■□□□□ 0,64
Pitx3O35160 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,05■□□□□ 0,64
Pitx3O35160 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19,05■□□□□ 0,64
Pitx3O35160 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC19,05■□□□□ 0,64
Pitx3O35160 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19,05■□□□□ 0,64
Pitx3O35160 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,05■□□□□ 0,64
Pitx3O35160 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC19,05■□□□□ 0,64
Pitx3O35160 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19,04■□□□□ 0,64
Pitx3O35160 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19,04■□□□□ 0,64
Pitx3O35160 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19,04■□□□□ 0,64
Pitx3O35160 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19,04■□□□□ 0,64
Pitx3O35160 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,04■□□□□ 0,64
Pitx3O35160 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19,04■□□□□ 0,64
Pitx3O35160 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC19,03■□□□□ 0,64
Pitx3O35160 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC19,03■□□□□ 0,64
Pitx3O35160 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,03■□□□□ 0,64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15,4 ms