Protein–RNA interactions for Protein: O35066

Kif3c, Kinesin-like protein KIF3C, mousemouse

Predictions only

Length 796 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kif3cO35066 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Kif3cO35066 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Kif3cO35066 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Kif3cO35066 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Kif3cO35066 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Kif3cO35066 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Kif3cO35066 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Kif3cO35066 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Kif3cO35066 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Kif3cO35066 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Kif3cO35066 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Kif3cO35066 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Kif3cO35066 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Kif3cO35066 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Kif3cO35066 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Kif3cO35066 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Kif3cO35066 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Kif3cO35066 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Kif3cO35066 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Kif3cO35066 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Kif3cO35066 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Kif3cO35066 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Kif3cO35066 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Kif3cO35066 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Kif3cO35066 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Kif3cO35066 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Kif3cO35066 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Kif3cO35066 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Kif3cO35066 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Kif3cO35066 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Kif3cO35066 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Kif3cO35066 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Kif3cO35066 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Kif3cO35066 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Kif3cO35066 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Kif3cO35066 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Kif3cO35066 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Kif3cO35066 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Kif3cO35066 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Kif3cO35066 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Kif3cO35066 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Kif3cO35066 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Kif3cO35066 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Kif3cO35066 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Kif3cO35066 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Kif3cO35066 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Kif3cO35066 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Kif3cO35066 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Kif3cO35066 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Kif3cO35066 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Kif3cO35066 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Kif3cO35066 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Kif3cO35066 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Kif3cO35066 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Kif3cO35066 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Kif3cO35066 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Kif3cO35066 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Kif3cO35066 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Kif3cO35066 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Kif3cO35066 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Kif3cO35066 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Kif3cO35066 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Kif3cO35066 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Kif3cO35066 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Kif3cO35066 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Kif3cO35066 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Kif3cO35066 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Kif3cO35066 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Kif3cO35066 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Kif3cO35066 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Kif3cO35066 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Kif3cO35066 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Kif3cO35066 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Kif3cO35066 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Kif3cO35066 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Kif3cO35066 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Kif3cO35066 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Kif3cO35066 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Kif3cO35066 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Kif3cO35066 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Kif3cO35066 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Kif3cO35066 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Kif3cO35066 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Kif3cO35066 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Kif3cO35066 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Kif3cO35066 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Kif3cO35066 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Kif3cO35066 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Kif3cO35066 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Kif3cO35066 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Kif3cO35066 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Kif3cO35066 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Kif3cO35066 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Kif3cO35066 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Kif3cO35066 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Kif3cO35066 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Kif3cO35066 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Kif3cO35066 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Kif3cO35066 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Kif3cO35066 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12 ms