Protein–RNA interactions for Protein: O08601

Mttp, Microsomal triglyceride transfer protein large subunit, mousemouse

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Length 894 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MttpO08601 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MttpO08601 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
MttpO08601 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MttpO08601 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MttpO08601 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MttpO08601 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
MttpO08601 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MttpO08601 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
MttpO08601 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MttpO08601 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MttpO08601 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MttpO08601 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MttpO08601 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MttpO08601 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MttpO08601 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
MttpO08601 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
MttpO08601 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
MttpO08601 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
MttpO08601 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MttpO08601 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MttpO08601 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
MttpO08601 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MttpO08601 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MttpO08601 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
MttpO08601 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
MttpO08601 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MttpO08601 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MttpO08601 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MttpO08601 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
MttpO08601 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MttpO08601 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
MttpO08601 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
MttpO08601 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MttpO08601 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
MttpO08601 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MttpO08601 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MttpO08601 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MttpO08601 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
MttpO08601 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MttpO08601 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MttpO08601 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
MttpO08601 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
MttpO08601 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MttpO08601 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MttpO08601 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MttpO08601 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MttpO08601 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MttpO08601 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MttpO08601 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
MttpO08601 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MttpO08601 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MttpO08601 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
MttpO08601 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
MttpO08601 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
MttpO08601 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MttpO08601 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MttpO08601 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
MttpO08601 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MttpO08601 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
MttpO08601 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
MttpO08601 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
MttpO08601 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
MttpO08601 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
MttpO08601 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
MttpO08601 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
MttpO08601 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
MttpO08601 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
MttpO08601 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
MttpO08601 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
MttpO08601 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
MttpO08601 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
MttpO08601 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
MttpO08601 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
MttpO08601 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MttpO08601 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
MttpO08601 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
MttpO08601 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
MttpO08601 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
MttpO08601 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
MttpO08601 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
MttpO08601 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
MttpO08601 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
MttpO08601 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
MttpO08601 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
MttpO08601 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
MttpO08601 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
MttpO08601 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
MttpO08601 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
MttpO08601 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
MttpO08601 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
MttpO08601 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
MttpO08601 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
MttpO08601 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
MttpO08601 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
MttpO08601 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
MttpO08601 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
MttpO08601 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
MttpO08601 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
MttpO08601 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
MttpO08601 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
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