Protein–RNA interactions for Protein: J3QNP2

Smim18, Small integral membrane protein 18, mousemouse

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Length 93 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim18J3QNP2 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Smim18J3QNP2 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Smim18J3QNP2 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Smim18J3QNP2 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Smim18J3QNP2 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Smim18J3QNP2 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Smim18J3QNP2 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Smim18J3QNP2 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Smim18J3QNP2 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Smim18J3QNP2 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Smim18J3QNP2 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Smim18J3QNP2 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Smim18J3QNP2 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Smim18J3QNP2 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Smim18J3QNP2 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Smim18J3QNP2 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Smim18J3QNP2 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Smim18J3QNP2 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Smim18J3QNP2 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Smim18J3QNP2 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Smim18J3QNP2 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Smim18J3QNP2 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Smim18J3QNP2 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Smim18J3QNP2 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Smim18J3QNP2 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Smim18J3QNP2 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Smim18J3QNP2 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Smim18J3QNP2 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Smim18J3QNP2 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Smim18J3QNP2 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Smim18J3QNP2 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Smim18J3QNP2 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Smim18J3QNP2 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Smim18J3QNP2 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Smim18J3QNP2 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Smim18J3QNP2 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Smim18J3QNP2 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Smim18J3QNP2 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Smim18J3QNP2 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Smim18J3QNP2 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Smim18J3QNP2 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Smim18J3QNP2 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Smim18J3QNP2 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Smim18J3QNP2 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Smim18J3QNP2 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Smim18J3QNP2 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Smim18J3QNP2 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Smim18J3QNP2 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Smim18J3QNP2 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Smim18J3QNP2 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Smim18J3QNP2 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Smim18J3QNP2 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Smim18J3QNP2 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Smim18J3QNP2 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Smim18J3QNP2 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Smim18J3QNP2 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Smim18J3QNP2 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Smim18J3QNP2 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Smim18J3QNP2 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Smim18J3QNP2 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Smim18J3QNP2 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Smim18J3QNP2 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Smim18J3QNP2 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Smim18J3QNP2 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Smim18J3QNP2 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Smim18J3QNP2 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Smim18J3QNP2 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Smim18J3QNP2 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Smim18J3QNP2 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Smim18J3QNP2 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Smim18J3QNP2 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Smim18J3QNP2 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Smim18J3QNP2 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Smim18J3QNP2 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Smim18J3QNP2 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Smim18J3QNP2 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Smim18J3QNP2 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Smim18J3QNP2 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Smim18J3QNP2 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Smim18J3QNP2 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Smim18J3QNP2 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Smim18J3QNP2 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Smim18J3QNP2 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Smim18J3QNP2 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Smim18J3QNP2 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Smim18J3QNP2 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Smim18J3QNP2 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Smim18J3QNP2 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Smim18J3QNP2 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Smim18J3QNP2 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Smim18J3QNP2 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Smim18J3QNP2 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Smim18J3QNP2 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Smim18J3QNP2 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Smim18J3QNP2 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Smim18J3QNP2 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Smim18J3QNP2 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Smim18J3QNP2 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Smim18J3QNP2 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Smim18J3QNP2 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
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