Protein–RNA interactions for Protein: J3QNE4

Ccdc180, Coiled-coil domain-containing 180, mousemouse

Predictions only

Length 1,664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc180J3QNE4 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44,36■■■■■ 4,69
Ccdc180J3QNE4 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC44,36■■■■■ 4,69
Ccdc180J3QNE4 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC44,35■■■■■ 4,69
Ccdc180J3QNE4 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC44,35■■■■■ 4,69
Ccdc180J3QNE4 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC44,34■■■■■ 4,69
Ccdc180J3QNE4 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC44,33■■■■■ 4,69
Ccdc180J3QNE4 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC44,33■■■■■ 4,69
Ccdc180J3QNE4 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC44,33■■■■■ 4,69
Ccdc180J3QNE4 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC44,32■■■■■ 4,69
Ccdc180J3QNE4 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC44,32■■■■■ 4,69
Ccdc180J3QNE4 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC44,3■■■■■ 4,68
Ccdc180J3QNE4 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC44,3■■■■■ 4,68
Ccdc180J3QNE4 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC44,3■■■■■ 4,68
Ccdc180J3QNE4 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC44,28■■■■■ 4,68
Ccdc180J3QNE4 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC44,26■■■■■ 4,68
Ccdc180J3QNE4 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC44,26■■■■■ 4,68
Ccdc180J3QNE4 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC44,26■■■■■ 4,68
Ccdc180J3QNE4 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC44,26■■■■■ 4,68
Ccdc180J3QNE4 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC44,24■■■■■ 4,67
Ccdc180J3QNE4 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC44,24■■■■■ 4,67
Ccdc180J3QNE4 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44,23■■■■■ 4,67
Ccdc180J3QNE4 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44,23■■■■■ 4,67
Ccdc180J3QNE4 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC44,22■■■■■ 4,67
Ccdc180J3QNE4 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44,21■■■■■ 4,67
Ccdc180J3QNE4 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC44,2■■■■■ 4,67
Ccdc180J3QNE4 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC44,19■■■■■ 4,67
Ccdc180J3QNE4 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC44,19■■■■■ 4,67
Ccdc180J3QNE4 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44,19■■■■■ 4,67
Ccdc180J3QNE4 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC44,19■■■■■ 4,67
Ccdc180J3QNE4 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44,19■■■■■ 4,66
Ccdc180J3QNE4 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC44,19■■■■■ 4,66
Ccdc180J3QNE4 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC44,19■■■■■ 4,66
Ccdc180J3QNE4 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC44,19■■■■■ 4,66
Ccdc180J3QNE4 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44,19■■■■■ 4,66
Ccdc180J3QNE4 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC44,19■■■■■ 4,66
Ccdc180J3QNE4 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC44,18■■■■■ 4,66
Ccdc180J3QNE4 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC44,18■■■■■ 4,66
Ccdc180J3QNE4 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC44,18■■■■■ 4,66
Ccdc180J3QNE4 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC44,18■■■■■ 4,66
Ccdc180J3QNE4 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC44,18■■■■■ 4,66
Ccdc180J3QNE4 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC44,18■■■■■ 4,66
Ccdc180J3QNE4 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC44,18■■■■■ 4,66
Ccdc180J3QNE4 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC44,17■■■■■ 4,66
Ccdc180J3QNE4 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44,16■■■■■ 4,66
Ccdc180J3QNE4 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44,16■■■■■ 4,66
Ccdc180J3QNE4 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC44,16■■■■■ 4,66
Ccdc180J3QNE4 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC44,15■■■■■ 4,66
Ccdc180J3QNE4 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC44,13■■■■■ 4,66
Ccdc180J3QNE4 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC44,11■■■■■ 4,65
Ccdc180J3QNE4 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC44,11■■■■■ 4,65
Ccdc180J3QNE4 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC44,1■■■■■ 4,65
Ccdc180J3QNE4 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC44,09■■■■■ 4,65
Ccdc180J3QNE4 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC44,09■■■■■ 4,65
Ccdc180J3QNE4 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC44,06■■■■■ 4,64
Ccdc180J3QNE4 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44,06■■■■■ 4,64
Ccdc180J3QNE4 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44,05■■■■■ 4,64
Ccdc180J3QNE4 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44,04■■■■■ 4,64
Ccdc180J3QNE4 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC44,04■■■■■ 4,64
Ccdc180J3QNE4 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC44,04■■■■■ 4,64
Ccdc180J3QNE4 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44,04■■■■■ 4,64
Ccdc180J3QNE4 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44,03■■■■■ 4,64
Ccdc180J3QNE4 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC44,03■■■■■ 4,64
Ccdc180J3QNE4 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC44,02■■■■■ 4,64
Ccdc180J3QNE4 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC44,02■■■■■ 4,64
Ccdc180J3QNE4 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC44,02■■■■■ 4,64
Ccdc180J3QNE4 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44,01■■■■■ 4,64
Ccdc180J3QNE4 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC44■■■■■ 4,63
Ccdc180J3QNE4 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44■■■■■ 4,63
Ccdc180J3QNE4 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43,98■■■■■ 4,63
Ccdc180J3QNE4 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC43,96■■■■■ 4,63
Ccdc180J3QNE4 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43,96■■■■■ 4,63
Ccdc180J3QNE4 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43,95■■■■■ 4,63
Ccdc180J3QNE4 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC43,94■■■■■ 4,63
Ccdc180J3QNE4 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC43,93■■■■■ 4,62
Ccdc180J3QNE4 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC43,93■■■■■ 4,62
Ccdc180J3QNE4 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43,93■■■■■ 4,62
Ccdc180J3QNE4 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43,92■■■■■ 4,62
Ccdc180J3QNE4 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC43,92■■■■■ 4,62
Ccdc180J3QNE4 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC43,91■■■■■ 4,62
Ccdc180J3QNE4 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43,9■■■■■ 4,62
Ccdc180J3QNE4 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC43,9■■■■■ 4,62
Ccdc180J3QNE4 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC43,9■■■■■ 4,62
Ccdc180J3QNE4 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC43,89■■■■■ 4,62
Ccdc180J3QNE4 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC43,88■■■■■ 4,62
Ccdc180J3QNE4 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43,88■■■■■ 4,62
Ccdc180J3QNE4 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43,88■■■■■ 4,61
Ccdc180J3QNE4 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC43,88■■■■■ 4,61
Ccdc180J3QNE4 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC43,87■■■■■ 4,61
Ccdc180J3QNE4 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43,87■■■■■ 4,61
Ccdc180J3QNE4 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC43,87■■■■■ 4,61
Ccdc180J3QNE4 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43,84■■■■■ 4,61
Ccdc180J3QNE4 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC43,83■■■■■ 4,61
Ccdc180J3QNE4 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC43,83■■■■■ 4,61
Ccdc180J3QNE4 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC43,83■■■■■ 4,61
Ccdc180J3QNE4 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43,82■■■■■ 4,61
Ccdc180J3QNE4 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC43,82■■■■■ 4,61
Ccdc180J3QNE4 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43,82■■■■■ 4,61
Ccdc180J3QNE4 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43,82■■■■■ 4,6
Ccdc180J3QNE4 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43,82■■■■■ 4,6
Ccdc180J3QNE4 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC43,81■■■■■ 4,6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11,8 ms