Protein–RNA interactions for Protein: J3QM76

Ccdc179, Coiled-coil domain-containing protein 179, mousemouse

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Length 67 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc179J3QM76 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc179J3QM76 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc179J3QM76 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc179J3QM76 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc179J3QM76 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc179J3QM76 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc179J3QM76 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc179J3QM76 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc179J3QM76 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc179J3QM76 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc179J3QM76 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc179J3QM76 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc179J3QM76 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc179J3QM76 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc179J3QM76 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc179J3QM76 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ccdc179J3QM76 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ccdc179J3QM76 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ccdc179J3QM76 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ccdc179J3QM76 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ccdc179J3QM76 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Ccdc179J3QM76 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ccdc179J3QM76 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ccdc179J3QM76 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ccdc179J3QM76 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc179J3QM76 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc179J3QM76 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc179J3QM76 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc179J3QM76 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc179J3QM76 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc179J3QM76 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc179J3QM76 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc179J3QM76 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc179J3QM76 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc179J3QM76 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc179J3QM76 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc179J3QM76 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc179J3QM76 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc179J3QM76 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc179J3QM76 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc179J3QM76 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc179J3QM76 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc179J3QM76 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc179J3QM76 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc179J3QM76 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc179J3QM76 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc179J3QM76 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc179J3QM76 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc179J3QM76 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc179J3QM76 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ccdc179J3QM76 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc179J3QM76 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc179J3QM76 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc179J3QM76 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc179J3QM76 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc179J3QM76 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc179J3QM76 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc179J3QM76 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc179J3QM76 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc179J3QM76 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc179J3QM76 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc179J3QM76 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc179J3QM76 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc179J3QM76 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc179J3QM76 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc179J3QM76 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc179J3QM76 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc179J3QM76 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc179J3QM76 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc179J3QM76 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc179J3QM76 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc179J3QM76 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc179J3QM76 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc179J3QM76 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc179J3QM76 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc179J3QM76 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc179J3QM76 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc179J3QM76 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc179J3QM76 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc179J3QM76 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc179J3QM76 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc179J3QM76 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc179J3QM76 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc179J3QM76 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc179J3QM76 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc179J3QM76 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc179J3QM76 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc179J3QM76 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc179J3QM76 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc179J3QM76 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc179J3QM76 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc179J3QM76 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc179J3QM76 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc179J3QM76 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc179J3QM76 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc179J3QM76 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc179J3QM76 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc179J3QM76 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc179J3QM76 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc179J3QM76 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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