Protein–RNA interactions for Protein: J3KMU2

Gm21820, Predicted gene, 21820, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21820J3KMU2 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gm21820J3KMU2 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Gm21820J3KMU2 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gm21820J3KMU2 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gm21820J3KMU2 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gm21820J3KMU2 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gm21820J3KMU2 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gm21820J3KMU2 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gm21820J3KMU2 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gm21820J3KMU2 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gm21820J3KMU2 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gm21820J3KMU2 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gm21820J3KMU2 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gm21820J3KMU2 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gm21820J3KMU2 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gm21820J3KMU2 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gm21820J3KMU2 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gm21820J3KMU2 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gm21820J3KMU2 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gm21820J3KMU2 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gm21820J3KMU2 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gm21820J3KMU2 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gm21820J3KMU2 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gm21820J3KMU2 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gm21820J3KMU2 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gm21820J3KMU2 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gm21820J3KMU2 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Gm21820J3KMU2 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gm21820J3KMU2 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gm21820J3KMU2 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gm21820J3KMU2 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gm21820J3KMU2 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gm21820J3KMU2 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gm21820J3KMU2 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gm21820J3KMU2 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gm21820J3KMU2 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Gm21820J3KMU2 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gm21820J3KMU2 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gm21820J3KMU2 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gm21820J3KMU2 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Gm21820J3KMU2 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
Gm21820J3KMU2 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
Gm21820J3KMU2 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Gm21820J3KMU2 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gm21820J3KMU2 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gm21820J3KMU2 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gm21820J3KMU2 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gm21820J3KMU2 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gm21820J3KMU2 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gm21820J3KMU2 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gm21820J3KMU2 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Gm21820J3KMU2 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gm21820J3KMU2 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gm21820J3KMU2 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gm21820J3KMU2 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gm21820J3KMU2 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gm21820J3KMU2 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC21.52■■□□□ 1.03
Gm21820J3KMU2 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gm21820J3KMU2 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gm21820J3KMU2 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gm21820J3KMU2 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gm21820J3KMU2 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gm21820J3KMU2 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gm21820J3KMU2 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gm21820J3KMU2 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gm21820J3KMU2 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gm21820J3KMU2 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gm21820J3KMU2 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gm21820J3KMU2 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gm21820J3KMU2 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gm21820J3KMU2 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm21820J3KMU2 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm21820J3KMU2 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm21820J3KMU2 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm21820J3KMU2 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm21820J3KMU2 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm21820J3KMU2 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm21820J3KMU2 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm21820J3KMU2 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gm21820J3KMU2 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gm21820J3KMU2 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gm21820J3KMU2 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gm21820J3KMU2 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gm21820J3KMU2 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm21820J3KMU2 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm21820J3KMU2 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm21820J3KMU2 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm21820J3KMU2 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm21820J3KMU2 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm21820J3KMU2 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm21820J3KMU2 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm21820J3KMU2 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm21820J3KMU2 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gm21820J3KMU2 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gm21820J3KMU2 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gm21820J3KMU2 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gm21820J3KMU2 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gm21820J3KMU2 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gm21820J3KMU2 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gm21820J3KMU2 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.6 ms