Protein–RNA interactions for Protein: G3X939

Slc9a3, Sodium/hydrogen exchanger 3, mousemouse

Predictions only

Length 829 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc9a3G3X939 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Slc9a3G3X939 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Slc9a3G3X939 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Slc9a3G3X939 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Slc9a3G3X939 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Slc9a3G3X939 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Slc9a3G3X939 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Slc9a3G3X939 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Slc9a3G3X939 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Slc9a3G3X939 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Slc9a3G3X939 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Slc9a3G3X939 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Slc9a3G3X939 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Slc9a3G3X939 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Slc9a3G3X939 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Slc9a3G3X939 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Slc9a3G3X939 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Slc9a3G3X939 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Slc9a3G3X939 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Slc9a3G3X939 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Slc9a3G3X939 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Slc9a3G3X939 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Slc9a3G3X939 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Slc9a3G3X939 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Slc9a3G3X939 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Slc9a3G3X939 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Slc9a3G3X939 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Slc9a3G3X939 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Slc9a3G3X939 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Slc9a3G3X939 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Slc9a3G3X939 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Slc9a3G3X939 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Slc9a3G3X939 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Slc9a3G3X939 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Slc9a3G3X939 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Slc9a3G3X939 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Slc9a3G3X939 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Slc9a3G3X939 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Slc9a3G3X939 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Slc9a3G3X939 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Slc9a3G3X939 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Slc9a3G3X939 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Slc9a3G3X939 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Slc9a3G3X939 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Slc9a3G3X939 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Slc9a3G3X939 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Slc9a3G3X939 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Slc9a3G3X939 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Slc9a3G3X939 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Slc9a3G3X939 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Slc9a3G3X939 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Slc9a3G3X939 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Slc9a3G3X939 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Slc9a3G3X939 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Slc9a3G3X939 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Slc9a3G3X939 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Slc9a3G3X939 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Slc9a3G3X939 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Slc9a3G3X939 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Slc9a3G3X939 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Slc9a3G3X939 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Slc9a3G3X939 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Slc9a3G3X939 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Slc9a3G3X939 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Slc9a3G3X939 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Slc9a3G3X939 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Slc9a3G3X939 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Slc9a3G3X939 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Slc9a3G3X939 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Slc9a3G3X939 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Slc9a3G3X939 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Slc9a3G3X939 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Slc9a3G3X939 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Slc9a3G3X939 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Slc9a3G3X939 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Slc9a3G3X939 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Slc9a3G3X939 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Slc9a3G3X939 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Slc9a3G3X939 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Slc9a3G3X939 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Slc9a3G3X939 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Slc9a3G3X939 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Slc9a3G3X939 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Slc9a3G3X939 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Slc9a3G3X939 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Slc9a3G3X939 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Slc9a3G3X939 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Slc9a3G3X939 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Slc9a3G3X939 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Slc9a3G3X939 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Slc9a3G3X939 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Slc9a3G3X939 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Slc9a3G3X939 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Slc9a3G3X939 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Slc9a3G3X939 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Slc9a3G3X939 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Slc9a3G3X939 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Slc9a3G3X939 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Slc9a3G3X939 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Slc9a3G3X939 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms