Protein–RNA interactions for Protein: G3X8U3

2210016F16Rik, MCG6895, mousemouse

Predictions only

Length 338 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
2210016F16RikG3X8U3 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
2210016F16RikG3X8U3 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
2210016F16RikG3X8U3 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
2210016F16RikG3X8U3 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
2210016F16RikG3X8U3 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
2210016F16RikG3X8U3 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
2210016F16RikG3X8U3 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
2210016F16RikG3X8U3 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
2210016F16RikG3X8U3 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
2210016F16RikG3X8U3 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
2210016F16RikG3X8U3 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
2210016F16RikG3X8U3 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
2210016F16RikG3X8U3 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
2210016F16RikG3X8U3 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
2210016F16RikG3X8U3 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
2210016F16RikG3X8U3 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
2210016F16RikG3X8U3 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
2210016F16RikG3X8U3 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
2210016F16RikG3X8U3 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
2210016F16RikG3X8U3 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
2210016F16RikG3X8U3 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
2210016F16RikG3X8U3 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
2210016F16RikG3X8U3 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
2210016F16RikG3X8U3 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
2210016F16RikG3X8U3 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
2210016F16RikG3X8U3 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
2210016F16RikG3X8U3 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
2210016F16RikG3X8U3 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
2210016F16RikG3X8U3 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
2210016F16RikG3X8U3 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
2210016F16RikG3X8U3 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
2210016F16RikG3X8U3 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
2210016F16RikG3X8U3 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
2210016F16RikG3X8U3 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
2210016F16RikG3X8U3 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
2210016F16RikG3X8U3 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
2210016F16RikG3X8U3 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
2210016F16RikG3X8U3 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
2210016F16RikG3X8U3 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
2210016F16RikG3X8U3 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
2210016F16RikG3X8U3 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
2210016F16RikG3X8U3 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
2210016F16RikG3X8U3 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
2210016F16RikG3X8U3 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
2210016F16RikG3X8U3 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
2210016F16RikG3X8U3 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
2210016F16RikG3X8U3 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
2210016F16RikG3X8U3 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
2210016F16RikG3X8U3 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
2210016F16RikG3X8U3 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
2210016F16RikG3X8U3 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
2210016F16RikG3X8U3 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
2210016F16RikG3X8U3 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
2210016F16RikG3X8U3 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
2210016F16RikG3X8U3 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
2210016F16RikG3X8U3 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
2210016F16RikG3X8U3 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
2210016F16RikG3X8U3 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
2210016F16RikG3X8U3 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
2210016F16RikG3X8U3 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
2210016F16RikG3X8U3 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
2210016F16RikG3X8U3 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
2210016F16RikG3X8U3 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
2210016F16RikG3X8U3 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
2210016F16RikG3X8U3 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
2210016F16RikG3X8U3 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
2210016F16RikG3X8U3 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
2210016F16RikG3X8U3 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
2210016F16RikG3X8U3 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
2210016F16RikG3X8U3 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
2210016F16RikG3X8U3 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
2210016F16RikG3X8U3 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
2210016F16RikG3X8U3 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
2210016F16RikG3X8U3 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
2210016F16RikG3X8U3 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
2210016F16RikG3X8U3 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
2210016F16RikG3X8U3 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
2210016F16RikG3X8U3 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
2210016F16RikG3X8U3 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
2210016F16RikG3X8U3 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
2210016F16RikG3X8U3 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
2210016F16RikG3X8U3 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
2210016F16RikG3X8U3 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
2210016F16RikG3X8U3 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
2210016F16RikG3X8U3 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
2210016F16RikG3X8U3 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
2210016F16RikG3X8U3 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
2210016F16RikG3X8U3 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
2210016F16RikG3X8U3 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
2210016F16RikG3X8U3 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
2210016F16RikG3X8U3 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
2210016F16RikG3X8U3 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
2210016F16RikG3X8U3 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
2210016F16RikG3X8U3 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
2210016F16RikG3X8U3 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
2210016F16RikG3X8U3 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
2210016F16RikG3X8U3 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
2210016F16RikG3X8U3 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
2210016F16RikG3X8U3 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
2210016F16RikG3X8U3 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.4 ms