Protein–RNA interactions for Protein: F6VRJ8

Gm8247, Predicted gene 8247 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8247F6VRJ8 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gm8247F6VRJ8 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gm8247F6VRJ8 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gm8247F6VRJ8 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gm8247F6VRJ8 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gm8247F6VRJ8 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gm8247F6VRJ8 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gm8247F6VRJ8 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gm8247F6VRJ8 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gm8247F6VRJ8 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gm8247F6VRJ8 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gm8247F6VRJ8 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gm8247F6VRJ8 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gm8247F6VRJ8 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gm8247F6VRJ8 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gm8247F6VRJ8 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gm8247F6VRJ8 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gm8247F6VRJ8 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gm8247F6VRJ8 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gm8247F6VRJ8 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Gm8247F6VRJ8 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Gm8247F6VRJ8 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gm8247F6VRJ8 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gm8247F6VRJ8 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gm8247F6VRJ8 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gm8247F6VRJ8 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gm8247F6VRJ8 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gm8247F6VRJ8 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gm8247F6VRJ8 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gm8247F6VRJ8 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gm8247F6VRJ8 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gm8247F6VRJ8 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gm8247F6VRJ8 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gm8247F6VRJ8 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gm8247F6VRJ8 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gm8247F6VRJ8 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gm8247F6VRJ8 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gm8247F6VRJ8 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gm8247F6VRJ8 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gm8247F6VRJ8 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gm8247F6VRJ8 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gm8247F6VRJ8 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gm8247F6VRJ8 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gm8247F6VRJ8 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gm8247F6VRJ8 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gm8247F6VRJ8 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gm8247F6VRJ8 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gm8247F6VRJ8 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gm8247F6VRJ8 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gm8247F6VRJ8 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gm8247F6VRJ8 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gm8247F6VRJ8 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gm8247F6VRJ8 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gm8247F6VRJ8 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gm8247F6VRJ8 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gm8247F6VRJ8 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gm8247F6VRJ8 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gm8247F6VRJ8 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Gm8247F6VRJ8 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gm8247F6VRJ8 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gm8247F6VRJ8 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gm8247F6VRJ8 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gm8247F6VRJ8 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gm8247F6VRJ8 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gm8247F6VRJ8 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gm8247F6VRJ8 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gm8247F6VRJ8 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gm8247F6VRJ8 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gm8247F6VRJ8 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gm8247F6VRJ8 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gm8247F6VRJ8 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gm8247F6VRJ8 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gm8247F6VRJ8 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gm8247F6VRJ8 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gm8247F6VRJ8 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gm8247F6VRJ8 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gm8247F6VRJ8 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gm8247F6VRJ8 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gm8247F6VRJ8 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gm8247F6VRJ8 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gm8247F6VRJ8 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gm8247F6VRJ8 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gm8247F6VRJ8 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gm8247F6VRJ8 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gm8247F6VRJ8 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Gm8247F6VRJ8 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Gm8247F6VRJ8 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gm8247F6VRJ8 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gm8247F6VRJ8 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gm8247F6VRJ8 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gm8247F6VRJ8 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gm8247F6VRJ8 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gm8247F6VRJ8 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Gm8247F6VRJ8 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gm8247F6VRJ8 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gm8247F6VRJ8 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gm8247F6VRJ8 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gm8247F6VRJ8 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gm8247F6VRJ8 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gm8247F6VRJ8 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.6 ms