Protein–RNA interactions for Protein: F6RGI3

Gm340, Predicted gene 340, mousemouse

Predictions only

Length 1,242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm340F6RGI3 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gm340F6RGI3 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gm340F6RGI3 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gm340F6RGI3 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gm340F6RGI3 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Gm340F6RGI3 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gm340F6RGI3 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gm340F6RGI3 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gm340F6RGI3 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gm340F6RGI3 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gm340F6RGI3 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gm340F6RGI3 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gm340F6RGI3 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gm340F6RGI3 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gm340F6RGI3 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gm340F6RGI3 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gm340F6RGI3 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gm340F6RGI3 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gm340F6RGI3 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gm340F6RGI3 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gm340F6RGI3 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gm340F6RGI3 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gm340F6RGI3 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gm340F6RGI3 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gm340F6RGI3 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gm340F6RGI3 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gm340F6RGI3 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gm340F6RGI3 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gm340F6RGI3 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Gm340F6RGI3 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gm340F6RGI3 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gm340F6RGI3 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gm340F6RGI3 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gm340F6RGI3 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gm340F6RGI3 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gm340F6RGI3 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gm340F6RGI3 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gm340F6RGI3 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gm340F6RGI3 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gm340F6RGI3 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gm340F6RGI3 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gm340F6RGI3 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gm340F6RGI3 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gm340F6RGI3 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gm340F6RGI3 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gm340F6RGI3 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gm340F6RGI3 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Gm340F6RGI3 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gm340F6RGI3 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gm340F6RGI3 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gm340F6RGI3 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gm340F6RGI3 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gm340F6RGI3 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gm340F6RGI3 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gm340F6RGI3 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gm340F6RGI3 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gm340F6RGI3 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gm340F6RGI3 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gm340F6RGI3 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gm340F6RGI3 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gm340F6RGI3 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Gm340F6RGI3 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gm340F6RGI3 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gm340F6RGI3 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gm340F6RGI3 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gm340F6RGI3 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Gm340F6RGI3 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gm340F6RGI3 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gm340F6RGI3 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gm340F6RGI3 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gm340F6RGI3 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gm340F6RGI3 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gm340F6RGI3 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Gm340F6RGI3 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gm340F6RGI3 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gm340F6RGI3 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gm340F6RGI3 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gm340F6RGI3 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gm340F6RGI3 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gm340F6RGI3 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm340F6RGI3 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm340F6RGI3 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm340F6RGI3 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm340F6RGI3 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm340F6RGI3 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm340F6RGI3 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm340F6RGI3 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm340F6RGI3 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm340F6RGI3 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm340F6RGI3 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm340F6RGI3 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm340F6RGI3 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm340F6RGI3 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm340F6RGI3 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm340F6RGI3 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm340F6RGI3 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm340F6RGI3 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm340F6RGI3 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm340F6RGI3 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm340F6RGI3 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.8 ms