Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9K5

Trdn, Triadin, mousemouse

Predictions only

Length 693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrdnE9Q9K5 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
TrdnE9Q9K5 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC27.28■■□□□ 1.96
TrdnE9Q9K5 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
TrdnE9Q9K5 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
TrdnE9Q9K5 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
TrdnE9Q9K5 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
TrdnE9Q9K5 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
TrdnE9Q9K5 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TrdnE9Q9K5 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC27.25■■□□□ 1.95
TrdnE9Q9K5 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
TrdnE9Q9K5 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
TrdnE9Q9K5 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
TrdnE9Q9K5 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
TrdnE9Q9K5 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
TrdnE9Q9K5 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
TrdnE9Q9K5 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
TrdnE9Q9K5 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
TrdnE9Q9K5 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
TrdnE9Q9K5 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
TrdnE9Q9K5 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
TrdnE9Q9K5 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
TrdnE9Q9K5 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
TrdnE9Q9K5 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
TrdnE9Q9K5 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
TrdnE9Q9K5 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
TrdnE9Q9K5 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
TrdnE9Q9K5 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TrdnE9Q9K5 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TrdnE9Q9K5 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TrdnE9Q9K5 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TrdnE9Q9K5 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TrdnE9Q9K5 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TrdnE9Q9K5 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TrdnE9Q9K5 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
TrdnE9Q9K5 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TrdnE9Q9K5 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
TrdnE9Q9K5 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TrdnE9Q9K5 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TrdnE9Q9K5 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
TrdnE9Q9K5 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
TrdnE9Q9K5 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
TrdnE9Q9K5 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TrdnE9Q9K5 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
TrdnE9Q9K5 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TrdnE9Q9K5 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
TrdnE9Q9K5 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TrdnE9Q9K5 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TrdnE9Q9K5 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TrdnE9Q9K5 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TrdnE9Q9K5 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TrdnE9Q9K5 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TrdnE9Q9K5 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TrdnE9Q9K5 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TrdnE9Q9K5 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
TrdnE9Q9K5 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
TrdnE9Q9K5 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TrdnE9Q9K5 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
TrdnE9Q9K5 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TrdnE9Q9K5 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
TrdnE9Q9K5 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TrdnE9Q9K5 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TrdnE9Q9K5 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TrdnE9Q9K5 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TrdnE9Q9K5 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TrdnE9Q9K5 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TrdnE9Q9K5 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TrdnE9Q9K5 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TrdnE9Q9K5 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TrdnE9Q9K5 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
TrdnE9Q9K5 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TrdnE9Q9K5 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
TrdnE9Q9K5 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
TrdnE9Q9K5 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
TrdnE9Q9K5 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TrdnE9Q9K5 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TrdnE9Q9K5 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TrdnE9Q9K5 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
TrdnE9Q9K5 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TrdnE9Q9K5 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TrdnE9Q9K5 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
TrdnE9Q9K5 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
TrdnE9Q9K5 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TrdnE9Q9K5 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
TrdnE9Q9K5 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
TrdnE9Q9K5 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TrdnE9Q9K5 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TrdnE9Q9K5 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TrdnE9Q9K5 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC26.96■■□□□ 1.91
TrdnE9Q9K5 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
TrdnE9Q9K5 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TrdnE9Q9K5 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
TrdnE9Q9K5 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
TrdnE9Q9K5 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
TrdnE9Q9K5 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TrdnE9Q9K5 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
TrdnE9Q9K5 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TrdnE9Q9K5 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TrdnE9Q9K5 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TrdnE9Q9K5 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TrdnE9Q9K5 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.5 ms