Protein–RNA interactions for Protein: E9Q8N6

Aknad1, AKNA domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 675 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aknad1E9Q8N6 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Aknad1E9Q8N6 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Aknad1E9Q8N6 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Aknad1E9Q8N6 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
Aknad1E9Q8N6 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Aknad1E9Q8N6 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Aknad1E9Q8N6 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
Aknad1E9Q8N6 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Aknad1E9Q8N6 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Aknad1E9Q8N6 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Aknad1E9Q8N6 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Aknad1E9Q8N6 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
Aknad1E9Q8N6 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
Aknad1E9Q8N6 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
Aknad1E9Q8N6 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
Aknad1E9Q8N6 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
Aknad1E9Q8N6 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Aknad1E9Q8N6 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
Aknad1E9Q8N6 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
Aknad1E9Q8N6 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Aknad1E9Q8N6 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
Aknad1E9Q8N6 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
Aknad1E9Q8N6 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
Aknad1E9Q8N6 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Aknad1E9Q8N6 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Aknad1E9Q8N6 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Aknad1E9Q8N6 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Aknad1E9Q8N6 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
Aknad1E9Q8N6 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Aknad1E9Q8N6 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Aknad1E9Q8N6 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Aknad1E9Q8N6 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Aknad1E9Q8N6 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
Aknad1E9Q8N6 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Aknad1E9Q8N6 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Aknad1E9Q8N6 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
Aknad1E9Q8N6 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Aknad1E9Q8N6 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.25
Aknad1E9Q8N6 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
Aknad1E9Q8N6 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Aknad1E9Q8N6 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Aknad1E9Q8N6 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Aknad1E9Q8N6 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Aknad1E9Q8N6 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Aknad1E9Q8N6 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Aknad1E9Q8N6 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
Aknad1E9Q8N6 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Aknad1E9Q8N6 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Aknad1E9Q8N6 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Aknad1E9Q8N6 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Aknad1E9Q8N6 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Aknad1E9Q8N6 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Aknad1E9Q8N6 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Aknad1E9Q8N6 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Aknad1E9Q8N6 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
Aknad1E9Q8N6 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Aknad1E9Q8N6 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Aknad1E9Q8N6 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Aknad1E9Q8N6 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Aknad1E9Q8N6 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Aknad1E9Q8N6 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Aknad1E9Q8N6 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Aknad1E9Q8N6 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
Aknad1E9Q8N6 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
Aknad1E9Q8N6 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
Aknad1E9Q8N6 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Aknad1E9Q8N6 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC29■■■□□ 2.23
Aknad1E9Q8N6 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Aknad1E9Q8N6 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Aknad1E9Q8N6 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Aknad1E9Q8N6 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Aknad1E9Q8N6 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Aknad1E9Q8N6 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Aknad1E9Q8N6 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Aknad1E9Q8N6 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Aknad1E9Q8N6 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Aknad1E9Q8N6 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Aknad1E9Q8N6 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Aknad1E9Q8N6 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Aknad1E9Q8N6 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Aknad1E9Q8N6 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
Aknad1E9Q8N6 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
Aknad1E9Q8N6 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Aknad1E9Q8N6 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Aknad1E9Q8N6 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Aknad1E9Q8N6 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Aknad1E9Q8N6 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
Aknad1E9Q8N6 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
Aknad1E9Q8N6 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Aknad1E9Q8N6 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
Aknad1E9Q8N6 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Aknad1E9Q8N6 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Aknad1E9Q8N6 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Aknad1E9Q8N6 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Aknad1E9Q8N6 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Aknad1E9Q8N6 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
Aknad1E9Q8N6 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Aknad1E9Q8N6 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Aknad1E9Q8N6 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Aknad1E9Q8N6 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.6 ms