Protein–RNA interactions for Protein: E9PXQ7

Pcdh10, Protocadherin 10, mousemouse

Predictions only

Length 1,057 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcdh10E9PXQ7 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,52■■■■□ 3,6
Pcdh10E9PXQ7 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC37,5■■■■□ 3,59
Pcdh10E9PXQ7 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC37,48■■■■□ 3,59
Pcdh10E9PXQ7 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,48■■■■□ 3,59
Pcdh10E9PXQ7 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,47■■■■□ 3,59
Pcdh10E9PXQ7 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37,47■■■■□ 3,59
Pcdh10E9PXQ7 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,46■■■■□ 3,59
Pcdh10E9PXQ7 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC37,46■■■■□ 3,59
Pcdh10E9PXQ7 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC37,46■■■■□ 3,59
Pcdh10E9PXQ7 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,46■■■■□ 3,59
Pcdh10E9PXQ7 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC37,45■■■■□ 3,59
Pcdh10E9PXQ7 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC37,45■■■■□ 3,59
Pcdh10E9PXQ7 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC37,44■■■■□ 3,58
Pcdh10E9PXQ7 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37,44■■■■□ 3,58
Pcdh10E9PXQ7 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC37,44■■■■□ 3,58
Pcdh10E9PXQ7 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC37,42■■■■□ 3,58
Pcdh10E9PXQ7 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,4■■■■□ 3,58
Pcdh10E9PXQ7 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,4■■■■□ 3,58
Pcdh10E9PXQ7 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,4■■■■□ 3,58
Pcdh10E9PXQ7 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC37,39■■■■□ 3,58
Pcdh10E9PXQ7 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC37,39■■■■□ 3,58
Pcdh10E9PXQ7 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,39■■■■□ 3,58
Pcdh10E9PXQ7 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37,39■■■■□ 3,58
Pcdh10E9PXQ7 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,38■■■■□ 3,57
Pcdh10E9PXQ7 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37,37■■■■□ 3,57
Pcdh10E9PXQ7 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC37,37■■■■□ 3,57
Pcdh10E9PXQ7 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC37,36■■■■□ 3,57
Pcdh10E9PXQ7 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37,34■■■■□ 3,57
Pcdh10E9PXQ7 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC37,34■■■■□ 3,57
Pcdh10E9PXQ7 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC37,33■■■■□ 3,57
Pcdh10E9PXQ7 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC37,33■■■■□ 3,57
Pcdh10E9PXQ7 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37,33■■■■□ 3,57
Pcdh10E9PXQ7 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC37,32■■■■□ 3,56
Pcdh10E9PXQ7 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,32■■■■□ 3,56
Pcdh10E9PXQ7 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,3■■■■□ 3,56
Pcdh10E9PXQ7 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,29■■■■□ 3,56
Pcdh10E9PXQ7 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,27■■■■□ 3,56
Pcdh10E9PXQ7 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC37,27■■■■□ 3,56
Pcdh10E9PXQ7 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC37,27■■■■□ 3,56
Pcdh10E9PXQ7 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC37,26■■■■□ 3,56
Pcdh10E9PXQ7 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,26■■■■□ 3,56
Pcdh10E9PXQ7 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37,25■■■■□ 3,55
Pcdh10E9PXQ7 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37,25■■■■□ 3,55
Pcdh10E9PXQ7 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC37,25■■■■□ 3,55
Pcdh10E9PXQ7 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC37,24■■■■□ 3,55
Pcdh10E9PXQ7 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC37,23■■■■□ 3,55
Pcdh10E9PXQ7 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,23■■■■□ 3,55
Pcdh10E9PXQ7 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,21■■■■□ 3,55
Pcdh10E9PXQ7 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,2■■■■□ 3,55
Pcdh10E9PXQ7 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC37,2■■■■□ 3,55
Pcdh10E9PXQ7 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC37,2■■■■□ 3,55
Pcdh10E9PXQ7 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37,2■■■■□ 3,55
Pcdh10E9PXQ7 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,19■■■■□ 3,54
Pcdh10E9PXQ7 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC37,19■■■■□ 3,54
Pcdh10E9PXQ7 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,19■■■■□ 3,54
Pcdh10E9PXQ7 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,17■■■■□ 3,54
Pcdh10E9PXQ7 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,17■■■■□ 3,54
Pcdh10E9PXQ7 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC37,17■■■■□ 3,54
Pcdh10E9PXQ7 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,16■■■■□ 3,54
Pcdh10E9PXQ7 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC37,15■■■■□ 3,54
Pcdh10E9PXQ7 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37,15■■■■□ 3,54
Pcdh10E9PXQ7 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC37,15■■■■□ 3,54
Pcdh10E9PXQ7 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC37,14■■■■□ 3,54
Pcdh10E9PXQ7 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,14■■■■□ 3,54
Pcdh10E9PXQ7 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,14■■■■□ 3,54
Pcdh10E9PXQ7 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC37,13■■■■□ 3,53
Pcdh10E9PXQ7 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC37,13■■■■□ 3,53
Pcdh10E9PXQ7 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,11■■■■□ 3,53
Pcdh10E9PXQ7 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC37,11■■■■□ 3,53
Pcdh10E9PXQ7 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC37,11■■■■□ 3,53
Pcdh10E9PXQ7 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,11■■■■□ 3,53
Pcdh10E9PXQ7 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC37,1■■■■□ 3,53
Pcdh10E9PXQ7 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC37,09■■■■□ 3,53
Pcdh10E9PXQ7 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,09■■■■□ 3,53
Pcdh10E9PXQ7 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,08■■■■□ 3,53
Pcdh10E9PXQ7 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,08■■■■□ 3,53
Pcdh10E9PXQ7 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37,08■■■■□ 3,53
Pcdh10E9PXQ7 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC37,07■■■■□ 3,52
Pcdh10E9PXQ7 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,07■■■■□ 3,52
Pcdh10E9PXQ7 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,07■■■■□ 3,52
Pcdh10E9PXQ7 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC37,06■■■■□ 3,52
Pcdh10E9PXQ7 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC37,06■■■■□ 3,52
Pcdh10E9PXQ7 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC37,06■■■■□ 3,52
Pcdh10E9PXQ7 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC37,05■■■■□ 3,52
Pcdh10E9PXQ7 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC37,04■■■■□ 3,52
Pcdh10E9PXQ7 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37,04■■■■□ 3,52
Pcdh10E9PXQ7 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,04■■■■□ 3,52
Pcdh10E9PXQ7 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,04■■■■□ 3,52
Pcdh10E9PXQ7 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,04■■■■□ 3,52
Pcdh10E9PXQ7 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,03■■■■□ 3,52
Pcdh10E9PXQ7 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC37,03■■■■□ 3,52
Pcdh10E9PXQ7 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,03■■■■□ 3,52
Pcdh10E9PXQ7 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,02■■■■□ 3,52
Pcdh10E9PXQ7 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,02■■■■□ 3,52
Pcdh10E9PXQ7 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC37,02■■■■□ 3,52
Pcdh10E9PXQ7 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,01■■■■□ 3,52
Pcdh10E9PXQ7 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37,01■■■■□ 3,51
Pcdh10E9PXQ7 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3,51
Pcdh10E9PXQ7 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,99■■■■□ 3,51
Pcdh10E9PXQ7 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC36,99■■■■□ 3,51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25,6 ms