Protein–RNA interactions for Protein: E0CXC6

4930558K02Rik, RIKEN cDNA 4930558K02 gene, mousemouse

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930558K02RikE0CXC6 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
4930558K02RikE0CXC6 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
4930558K02RikE0CXC6 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
4930558K02RikE0CXC6 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
4930558K02RikE0CXC6 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
4930558K02RikE0CXC6 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.38■■□□□ 1.49
4930558K02RikE0CXC6 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
4930558K02RikE0CXC6 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
4930558K02RikE0CXC6 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
4930558K02RikE0CXC6 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
4930558K02RikE0CXC6 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
4930558K02RikE0CXC6 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
4930558K02RikE0CXC6 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
4930558K02RikE0CXC6 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
4930558K02RikE0CXC6 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
4930558K02RikE0CXC6 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
4930558K02RikE0CXC6 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
4930558K02RikE0CXC6 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
4930558K02RikE0CXC6 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
4930558K02RikE0CXC6 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
4930558K02RikE0CXC6 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
4930558K02RikE0CXC6 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
4930558K02RikE0CXC6 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
4930558K02RikE0CXC6 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
4930558K02RikE0CXC6 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
4930558K02RikE0CXC6 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
4930558K02RikE0CXC6 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
4930558K02RikE0CXC6 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
4930558K02RikE0CXC6 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
4930558K02RikE0CXC6 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
4930558K02RikE0CXC6 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
4930558K02RikE0CXC6 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
4930558K02RikE0CXC6 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
4930558K02RikE0CXC6 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
4930558K02RikE0CXC6 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
4930558K02RikE0CXC6 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
4930558K02RikE0CXC6 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
4930558K02RikE0CXC6 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
4930558K02RikE0CXC6 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
4930558K02RikE0CXC6 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
4930558K02RikE0CXC6 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
4930558K02RikE0CXC6 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
4930558K02RikE0CXC6 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
4930558K02RikE0CXC6 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
4930558K02RikE0CXC6 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
4930558K02RikE0CXC6 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
4930558K02RikE0CXC6 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
4930558K02RikE0CXC6 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
4930558K02RikE0CXC6 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
4930558K02RikE0CXC6 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
4930558K02RikE0CXC6 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
4930558K02RikE0CXC6 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
4930558K02RikE0CXC6 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
4930558K02RikE0CXC6 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
4930558K02RikE0CXC6 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
4930558K02RikE0CXC6 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
4930558K02RikE0CXC6 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
4930558K02RikE0CXC6 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
4930558K02RikE0CXC6 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
4930558K02RikE0CXC6 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
4930558K02RikE0CXC6 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
4930558K02RikE0CXC6 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
4930558K02RikE0CXC6 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
4930558K02RikE0CXC6 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
4930558K02RikE0CXC6 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
4930558K02RikE0CXC6 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
4930558K02RikE0CXC6 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
4930558K02RikE0CXC6 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
4930558K02RikE0CXC6 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
4930558K02RikE0CXC6 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
4930558K02RikE0CXC6 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
4930558K02RikE0CXC6 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
4930558K02RikE0CXC6 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
4930558K02RikE0CXC6 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
4930558K02RikE0CXC6 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
4930558K02RikE0CXC6 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
4930558K02RikE0CXC6 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
4930558K02RikE0CXC6 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
4930558K02RikE0CXC6 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
4930558K02RikE0CXC6 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
4930558K02RikE0CXC6 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
4930558K02RikE0CXC6 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
4930558K02RikE0CXC6 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
4930558K02RikE0CXC6 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
4930558K02RikE0CXC6 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
4930558K02RikE0CXC6 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
4930558K02RikE0CXC6 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
4930558K02RikE0CXC6 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
4930558K02RikE0CXC6 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
4930558K02RikE0CXC6 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
4930558K02RikE0CXC6 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
4930558K02RikE0CXC6 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
4930558K02RikE0CXC6 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
4930558K02RikE0CXC6 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
4930558K02RikE0CXC6 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
4930558K02RikE0CXC6 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
4930558K02RikE0CXC6 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
4930558K02RikE0CXC6 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
4930558K02RikE0CXC6 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
4930558K02RikE0CXC6 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms