Protein–RNA interactions for Protein: D3Z7Q2

Smim20, Small integral membrane protein 20, mousemouse

Predictions only

Length 69 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim20D3Z7Q2 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smim20D3Z7Q2 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smim20D3Z7Q2 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smim20D3Z7Q2 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smim20D3Z7Q2 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smim20D3Z7Q2 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smim20D3Z7Q2 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smim20D3Z7Q2 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smim20D3Z7Q2 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smim20D3Z7Q2 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smim20D3Z7Q2 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smim20D3Z7Q2 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smim20D3Z7Q2 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smim20D3Z7Q2 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smim20D3Z7Q2 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smim20D3Z7Q2 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smim20D3Z7Q2 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smim20D3Z7Q2 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smim20D3Z7Q2 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smim20D3Z7Q2 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smim20D3Z7Q2 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smim20D3Z7Q2 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smim20D3Z7Q2 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smim20D3Z7Q2 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smim20D3Z7Q2 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smim20D3Z7Q2 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smim20D3Z7Q2 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smim20D3Z7Q2 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smim20D3Z7Q2 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smim20D3Z7Q2 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smim20D3Z7Q2 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smim20D3Z7Q2 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smim20D3Z7Q2 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smim20D3Z7Q2 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smim20D3Z7Q2 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smim20D3Z7Q2 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smim20D3Z7Q2 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smim20D3Z7Q2 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smim20D3Z7Q2 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smim20D3Z7Q2 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smim20D3Z7Q2 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smim20D3Z7Q2 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smim20D3Z7Q2 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Smim20D3Z7Q2 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Smim20D3Z7Q2 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Smim20D3Z7Q2 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Smim20D3Z7Q2 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smim20D3Z7Q2 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smim20D3Z7Q2 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smim20D3Z7Q2 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smim20D3Z7Q2 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Smim20D3Z7Q2 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Smim20D3Z7Q2 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smim20D3Z7Q2 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Smim20D3Z7Q2 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Smim20D3Z7Q2 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smim20D3Z7Q2 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Smim20D3Z7Q2 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Smim20D3Z7Q2 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Smim20D3Z7Q2 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Smim20D3Z7Q2 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Smim20D3Z7Q2 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Smim20D3Z7Q2 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Smim20D3Z7Q2 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Smim20D3Z7Q2 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Smim20D3Z7Q2 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Smim20D3Z7Q2 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Smim20D3Z7Q2 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Smim20D3Z7Q2 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Smim20D3Z7Q2 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Smim20D3Z7Q2 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Smim20D3Z7Q2 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Smim20D3Z7Q2 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Smim20D3Z7Q2 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Smim20D3Z7Q2 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Smim20D3Z7Q2 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Smim20D3Z7Q2 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Smim20D3Z7Q2 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Smim20D3Z7Q2 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Smim20D3Z7Q2 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Smim20D3Z7Q2 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Smim20D3Z7Q2 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Smim20D3Z7Q2 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Smim20D3Z7Q2 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Smim20D3Z7Q2 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Smim20D3Z7Q2 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Smim20D3Z7Q2 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Smim20D3Z7Q2 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Smim20D3Z7Q2 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Smim20D3Z7Q2 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Smim20D3Z7Q2 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Smim20D3Z7Q2 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Smim20D3Z7Q2 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Smim20D3Z7Q2 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Smim20D3Z7Q2 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Smim20D3Z7Q2 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Smim20D3Z7Q2 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Smim20D3Z7Q2 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Smim20D3Z7Q2 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Smim20D3Z7Q2 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms