Protein–RNA interactions for Protein: D3Z2W7

Cyp3a59, Cytochrome P450, family 3, subfamily a, polypeptide 59, mousemouse

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp3a59D3Z2W7 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Cyp3a59D3Z2W7 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Cyp3a59D3Z2W7 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Cyp3a59D3Z2W7 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Cyp3a59D3Z2W7 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Cyp3a59D3Z2W7 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Cyp3a59D3Z2W7 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Cyp3a59D3Z2W7 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Cyp3a59D3Z2W7 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Cyp3a59D3Z2W7 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Cyp3a59D3Z2W7 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Cyp3a59D3Z2W7 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Cyp3a59D3Z2W7 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Cyp3a59D3Z2W7 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Cyp3a59D3Z2W7 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Cyp3a59D3Z2W7 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Cyp3a59D3Z2W7 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Cyp3a59D3Z2W7 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Cyp3a59D3Z2W7 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Cyp3a59D3Z2W7 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
Cyp3a59D3Z2W7 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Cyp3a59D3Z2W7 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Cyp3a59D3Z2W7 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Cyp3a59D3Z2W7 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Cyp3a59D3Z2W7 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Cyp3a59D3Z2W7 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Cyp3a59D3Z2W7 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Cyp3a59D3Z2W7 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Cyp3a59D3Z2W7 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Cyp3a59D3Z2W7 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Cyp3a59D3Z2W7 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Cyp3a59D3Z2W7 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Cyp3a59D3Z2W7 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Cyp3a59D3Z2W7 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Cyp3a59D3Z2W7 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Cyp3a59D3Z2W7 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
Cyp3a59D3Z2W7 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Cyp3a59D3Z2W7 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Cyp3a59D3Z2W7 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Cyp3a59D3Z2W7 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Cyp3a59D3Z2W7 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Cyp3a59D3Z2W7 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Cyp3a59D3Z2W7 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Cyp3a59D3Z2W7 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Cyp3a59D3Z2W7 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Cyp3a59D3Z2W7 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Cyp3a59D3Z2W7 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Cyp3a59D3Z2W7 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
Cyp3a59D3Z2W7 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Cyp3a59D3Z2W7 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Cyp3a59D3Z2W7 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Cyp3a59D3Z2W7 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Cyp3a59D3Z2W7 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Cyp3a59D3Z2W7 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Cyp3a59D3Z2W7 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC27.57■■■□□ 2
Cyp3a59D3Z2W7 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC27.57■■■□□ 2
Cyp3a59D3Z2W7 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Cyp3a59D3Z2W7 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Cyp3a59D3Z2W7 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Cyp3a59D3Z2W7 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
Cyp3a59D3Z2W7 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC27.53■■■□□ 2
Cyp3a59D3Z2W7 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Cyp3a59D3Z2W7 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Cyp3a59D3Z2W7 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC27.52■■■□□ 2
Cyp3a59D3Z2W7 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Cyp3a59D3Z2W7 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Cyp3a59D3Z2W7 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
Cyp3a59D3Z2W7 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Cyp3a59D3Z2W7 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Cyp3a59D3Z2W7 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Cyp3a59D3Z2W7 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Cyp3a59D3Z2W7 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Cyp3a59D3Z2W7 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Cyp3a59D3Z2W7 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Cyp3a59D3Z2W7 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Cyp3a59D3Z2W7 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Cyp3a59D3Z2W7 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Cyp3a59D3Z2W7 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Cyp3a59D3Z2W7 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Cyp3a59D3Z2W7 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Cyp3a59D3Z2W7 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
Cyp3a59D3Z2W7 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Cyp3a59D3Z2W7 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Cyp3a59D3Z2W7 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Cyp3a59D3Z2W7 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
Cyp3a59D3Z2W7 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
Cyp3a59D3Z2W7 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Cyp3a59D3Z2W7 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Cyp3a59D3Z2W7 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Cyp3a59D3Z2W7 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Cyp3a59D3Z2W7 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Cyp3a59D3Z2W7 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Cyp3a59D3Z2W7 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
Cyp3a59D3Z2W7 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Cyp3a59D3Z2W7 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Cyp3a59D3Z2W7 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Cyp3a59D3Z2W7 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Cyp3a59D3Z2W7 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Cyp3a59D3Z2W7 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Cyp3a59D3Z2W7 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms