Protein–RNA interactions for Protein: D3Z1P8

4930467E23Rik, RIKEN cDNA 4930467E23 gene, mousemouse

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930467E23RikD3Z1P8 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
4930467E23RikD3Z1P8 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
4930467E23RikD3Z1P8 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
4930467E23RikD3Z1P8 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
4930467E23RikD3Z1P8 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
4930467E23RikD3Z1P8 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
4930467E23RikD3Z1P8 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
4930467E23RikD3Z1P8 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
4930467E23RikD3Z1P8 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
4930467E23RikD3Z1P8 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
4930467E23RikD3Z1P8 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
4930467E23RikD3Z1P8 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
4930467E23RikD3Z1P8 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
4930467E23RikD3Z1P8 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
4930467E23RikD3Z1P8 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
4930467E23RikD3Z1P8 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
4930467E23RikD3Z1P8 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
4930467E23RikD3Z1P8 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
4930467E23RikD3Z1P8 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
4930467E23RikD3Z1P8 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
4930467E23RikD3Z1P8 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
4930467E23RikD3Z1P8 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
4930467E23RikD3Z1P8 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
4930467E23RikD3Z1P8 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
4930467E23RikD3Z1P8 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
4930467E23RikD3Z1P8 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
4930467E23RikD3Z1P8 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
4930467E23RikD3Z1P8 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
4930467E23RikD3Z1P8 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
4930467E23RikD3Z1P8 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
4930467E23RikD3Z1P8 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
4930467E23RikD3Z1P8 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
4930467E23RikD3Z1P8 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
4930467E23RikD3Z1P8 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
4930467E23RikD3Z1P8 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
4930467E23RikD3Z1P8 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
4930467E23RikD3Z1P8 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
4930467E23RikD3Z1P8 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
4930467E23RikD3Z1P8 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
4930467E23RikD3Z1P8 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
4930467E23RikD3Z1P8 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
4930467E23RikD3Z1P8 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
4930467E23RikD3Z1P8 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
4930467E23RikD3Z1P8 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
4930467E23RikD3Z1P8 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
4930467E23RikD3Z1P8 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
4930467E23RikD3Z1P8 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
4930467E23RikD3Z1P8 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
4930467E23RikD3Z1P8 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
4930467E23RikD3Z1P8 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
4930467E23RikD3Z1P8 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
4930467E23RikD3Z1P8 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
4930467E23RikD3Z1P8 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
4930467E23RikD3Z1P8 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
4930467E23RikD3Z1P8 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
4930467E23RikD3Z1P8 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
4930467E23RikD3Z1P8 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
4930467E23RikD3Z1P8 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
4930467E23RikD3Z1P8 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
4930467E23RikD3Z1P8 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
4930467E23RikD3Z1P8 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
4930467E23RikD3Z1P8 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
4930467E23RikD3Z1P8 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
4930467E23RikD3Z1P8 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
4930467E23RikD3Z1P8 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
4930467E23RikD3Z1P8 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
4930467E23RikD3Z1P8 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC20■□□□□ 0.79
4930467E23RikD3Z1P8 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
4930467E23RikD3Z1P8 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
4930467E23RikD3Z1P8 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
4930467E23RikD3Z1P8 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
4930467E23RikD3Z1P8 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
4930467E23RikD3Z1P8 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
4930467E23RikD3Z1P8 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
4930467E23RikD3Z1P8 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
4930467E23RikD3Z1P8 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
4930467E23RikD3Z1P8 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
4930467E23RikD3Z1P8 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
4930467E23RikD3Z1P8 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
4930467E23RikD3Z1P8 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
4930467E23RikD3Z1P8 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
4930467E23RikD3Z1P8 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
4930467E23RikD3Z1P8 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
4930467E23RikD3Z1P8 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
4930467E23RikD3Z1P8 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
4930467E23RikD3Z1P8 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
4930467E23RikD3Z1P8 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
4930467E23RikD3Z1P8 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
4930467E23RikD3Z1P8 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
4930467E23RikD3Z1P8 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
4930467E23RikD3Z1P8 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
4930467E23RikD3Z1P8 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
4930467E23RikD3Z1P8 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
4930467E23RikD3Z1P8 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
4930467E23RikD3Z1P8 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
4930467E23RikD3Z1P8 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
4930467E23RikD3Z1P8 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
4930467E23RikD3Z1P8 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
4930467E23RikD3Z1P8 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
4930467E23RikD3Z1P8 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61 ms