Protein–RNA interactions for Protein: D3YXK2

Safb, Scaffold attachment factor B1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 937 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SafbD3YXK2 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
SafbD3YXK2 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
SafbD3YXK2 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
SafbD3YXK2 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
SafbD3YXK2 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.63■■■□□ 2.49
SafbD3YXK2 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
SafbD3YXK2 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
SafbD3YXK2 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.62■■■□□ 2.49
SafbD3YXK2 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
SafbD3YXK2 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC30.61■■■□□ 2.49
SafbD3YXK2 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
SafbD3YXK2 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.6■■■□□ 2.49
SafbD3YXK2 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
SafbD3YXK2 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
SafbD3YXK2 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
SafbD3YXK2 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
SafbD3YXK2 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
SafbD3YXK2 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.57■■■□□ 2.48
SafbD3YXK2 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
SafbD3YXK2 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
SafbD3YXK2 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
SafbD3YXK2 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC30.56■■■□□ 2.48
SafbD3YXK2 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
SafbD3YXK2 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
SafbD3YXK2 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.54■■■□□ 2.48
SafbD3YXK2 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
SafbD3YXK2 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.54■■■□□ 2.48
SafbD3YXK2 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.53■■■□□ 2.48
SafbD3YXK2 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
SafbD3YXK2 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.53■■■□□ 2.48
SafbD3YXK2 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
SafbD3YXK2 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.53■■■□□ 2.48
SafbD3YXK2 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
SafbD3YXK2 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC30.52■■■□□ 2.48
SafbD3YXK2 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.51■■■□□ 2.48
SafbD3YXK2 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
SafbD3YXK2 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.51■■■□□ 2.47
SafbD3YXK2 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
SafbD3YXK2 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
SafbD3YXK2 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
SafbD3YXK2 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
SafbD3YXK2 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
SafbD3YXK2 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
SafbD3YXK2 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
SafbD3YXK2 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
SafbD3YXK2 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
SafbD3YXK2 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
SafbD3YXK2 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
SafbD3YXK2 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
SafbD3YXK2 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
SafbD3YXK2 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
SafbD3YXK2 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
SafbD3YXK2 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
SafbD3YXK2 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
SafbD3YXK2 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC30.41■■■□□ 2.46
SafbD3YXK2 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
SafbD3YXK2 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
SafbD3YXK2 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.4■■■□□ 2.46
SafbD3YXK2 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
SafbD3YXK2 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
SafbD3YXK2 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.45
SafbD3YXK2 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
SafbD3YXK2 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
SafbD3YXK2 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
SafbD3YXK2 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
SafbD3YXK2 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
SafbD3YXK2 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
SafbD3YXK2 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
SafbD3YXK2 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
SafbD3YXK2 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.35■■■□□ 2.45
SafbD3YXK2 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
SafbD3YXK2 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
SafbD3YXK2 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC30.34■■■□□ 2.45
SafbD3YXK2 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
SafbD3YXK2 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC30.33■■■□□ 2.45
SafbD3YXK2 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
SafbD3YXK2 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.33■■■□□ 2.45
SafbD3YXK2 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
SafbD3YXK2 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
SafbD3YXK2 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
SafbD3YXK2 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC30.32■■■□□ 2.44
SafbD3YXK2 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
SafbD3YXK2 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
SafbD3YXK2 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC30.32■■■□□ 2.44
SafbD3YXK2 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
SafbD3YXK2 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
SafbD3YXK2 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.3■■■□□ 2.44
SafbD3YXK2 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
SafbD3YXK2 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
SafbD3YXK2 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
SafbD3YXK2 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
SafbD3YXK2 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
SafbD3YXK2 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
SafbD3YXK2 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
SafbD3YXK2 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
SafbD3YXK2 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
SafbD3YXK2 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
SafbD3YXK2 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC30.26■■■□□ 2.43
SafbD3YXK2 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.26■■■□□ 2.43
SafbD3YXK2 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms