Protein–RNA interactions for Protein: B2RT41

Zfc3h1, Zinc finger, C3H1-type-containing, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,992 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfc3h1B2RT41 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Zfc3h1B2RT41 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Zfc3h1B2RT41 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Zfc3h1B2RT41 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Zfc3h1B2RT41 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Zfc3h1B2RT41 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Zfc3h1B2RT41 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Zfc3h1B2RT41 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Zfc3h1B2RT41 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Zfc3h1B2RT41 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Zfc3h1B2RT41 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Zfc3h1B2RT41 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Zfc3h1B2RT41 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Zfc3h1B2RT41 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Zfc3h1B2RT41 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Zfc3h1B2RT41 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Zfc3h1B2RT41 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Zfc3h1B2RT41 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Zfc3h1B2RT41 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Zfc3h1B2RT41 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Zfc3h1B2RT41 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Zfc3h1B2RT41 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Zfc3h1B2RT41 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Zfc3h1B2RT41 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Zfc3h1B2RT41 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Zfc3h1B2RT41 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Zfc3h1B2RT41 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Zfc3h1B2RT41 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Zfc3h1B2RT41 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Zfc3h1B2RT41 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Zfc3h1B2RT41 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Zfc3h1B2RT41 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Zfc3h1B2RT41 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Zfc3h1B2RT41 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Zfc3h1B2RT41 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Zfc3h1B2RT41 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Zfc3h1B2RT41 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Zfc3h1B2RT41 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Zfc3h1B2RT41 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Zfc3h1B2RT41 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Zfc3h1B2RT41 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Zfc3h1B2RT41 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Zfc3h1B2RT41 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Zfc3h1B2RT41 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Zfc3h1B2RT41 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Zfc3h1B2RT41 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Zfc3h1B2RT41 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Zfc3h1B2RT41 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Zfc3h1B2RT41 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Zfc3h1B2RT41 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Zfc3h1B2RT41 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Zfc3h1B2RT41 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Zfc3h1B2RT41 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Zfc3h1B2RT41 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Zfc3h1B2RT41 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Zfc3h1B2RT41 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Zfc3h1B2RT41 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Zfc3h1B2RT41 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Zfc3h1B2RT41 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Zfc3h1B2RT41 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Zfc3h1B2RT41 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Zfc3h1B2RT41 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Zfc3h1B2RT41 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Zfc3h1B2RT41 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Zfc3h1B2RT41 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Zfc3h1B2RT41 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Zfc3h1B2RT41 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Zfc3h1B2RT41 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Zfc3h1B2RT41 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Zfc3h1B2RT41 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Zfc3h1B2RT41 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Zfc3h1B2RT41 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Zfc3h1B2RT41 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Zfc3h1B2RT41 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Zfc3h1B2RT41 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Zfc3h1B2RT41 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Zfc3h1B2RT41 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Zfc3h1B2RT41 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Zfc3h1B2RT41 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Zfc3h1B2RT41 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Zfc3h1B2RT41 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Zfc3h1B2RT41 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Zfc3h1B2RT41 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Zfc3h1B2RT41 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Zfc3h1B2RT41 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Zfc3h1B2RT41 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Zfc3h1B2RT41 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Zfc3h1B2RT41 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Zfc3h1B2RT41 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Zfc3h1B2RT41 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Zfc3h1B2RT41 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Zfc3h1B2RT41 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Zfc3h1B2RT41 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Zfc3h1B2RT41 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Zfc3h1B2RT41 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Zfc3h1B2RT41 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Zfc3h1B2RT41 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Zfc3h1B2RT41 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Zfc3h1B2RT41 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Zfc3h1B2RT41 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 494 ms