Protein–RNA interactions for Protein: B2KF50

Uhrf1bp1, UHRF1 (ICBP90)-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uhrf1bp1B2KF50 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
Uhrf1bp1B2KF50 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.83■■■□□ 2.53
Uhrf1bp1B2KF50 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
Uhrf1bp1B2KF50 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
Uhrf1bp1B2KF50 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC30.82■■■□□ 2.52
Uhrf1bp1B2KF50 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
Uhrf1bp1B2KF50 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC30.8■■■□□ 2.52
Uhrf1bp1B2KF50 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
Uhrf1bp1B2KF50 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC30.78■■■□□ 2.52
Uhrf1bp1B2KF50 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC30.78■■■□□ 2.52
Uhrf1bp1B2KF50 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
Uhrf1bp1B2KF50 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
Uhrf1bp1B2KF50 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
Uhrf1bp1B2KF50 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
Uhrf1bp1B2KF50 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
Uhrf1bp1B2KF50 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC30.76■■■□□ 2.51
Uhrf1bp1B2KF50 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
Uhrf1bp1B2KF50 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC30.75■■■□□ 2.51
Uhrf1bp1B2KF50 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
Uhrf1bp1B2KF50 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.74■■■□□ 2.51
Uhrf1bp1B2KF50 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
Uhrf1bp1B2KF50 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
Uhrf1bp1B2KF50 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
Uhrf1bp1B2KF50 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
Uhrf1bp1B2KF50 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC30.72■■■□□ 2.51
Uhrf1bp1B2KF50 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
Uhrf1bp1B2KF50 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
Uhrf1bp1B2KF50 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC30.69■■■□□ 2.5
Uhrf1bp1B2KF50 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
Uhrf1bp1B2KF50 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
Uhrf1bp1B2KF50 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
Uhrf1bp1B2KF50 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
Uhrf1bp1B2KF50 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC30.66■■■□□ 2.5
Uhrf1bp1B2KF50 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
Uhrf1bp1B2KF50 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
Uhrf1bp1B2KF50 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
Uhrf1bp1B2KF50 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC30.64■■■□□ 2.49
Uhrf1bp1B2KF50 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.63■■■□□ 2.49
Uhrf1bp1B2KF50 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
Uhrf1bp1B2KF50 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.63■■■□□ 2.49
Uhrf1bp1B2KF50 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
Uhrf1bp1B2KF50 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
Uhrf1bp1B2KF50 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.63■■■□□ 2.49
Uhrf1bp1B2KF50 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
Uhrf1bp1B2KF50 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
Uhrf1bp1B2KF50 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
Uhrf1bp1B2KF50 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
Uhrf1bp1B2KF50 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC30.59■■■□□ 2.49
Uhrf1bp1B2KF50 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
Uhrf1bp1B2KF50 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
Uhrf1bp1B2KF50 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
Uhrf1bp1B2KF50 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
Uhrf1bp1B2KF50 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC30.58■■■□□ 2.49
Uhrf1bp1B2KF50 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
Uhrf1bp1B2KF50 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
Uhrf1bp1B2KF50 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC30.57■■■□□ 2.48
Uhrf1bp1B2KF50 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
Uhrf1bp1B2KF50 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
Uhrf1bp1B2KF50 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
Uhrf1bp1B2KF50 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC30.55■■■□□ 2.48
Uhrf1bp1B2KF50 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
Uhrf1bp1B2KF50 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
Uhrf1bp1B2KF50 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC30.53■■■□□ 2.48
Uhrf1bp1B2KF50 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC30.53■■■□□ 2.48
Uhrf1bp1B2KF50 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC30.52■■■□□ 2.48
Uhrf1bp1B2KF50 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.52■■■□□ 2.48
Uhrf1bp1B2KF50 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
Uhrf1bp1B2KF50 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Uhrf1bp1B2KF50 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Uhrf1bp1B2KF50 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
Uhrf1bp1B2KF50 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Uhrf1bp1B2KF50 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Uhrf1bp1B2KF50 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Uhrf1bp1B2KF50 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Uhrf1bp1B2KF50 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Uhrf1bp1B2KF50 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Uhrf1bp1B2KF50 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
Uhrf1bp1B2KF50 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
Uhrf1bp1B2KF50 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.46■■■□□ 2.47
Uhrf1bp1B2KF50 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
Uhrf1bp1B2KF50 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC30.45■■■□□ 2.46
Uhrf1bp1B2KF50 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC30.45■■■□□ 2.46
Uhrf1bp1B2KF50 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Uhrf1bp1B2KF50 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Uhrf1bp1B2KF50 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Uhrf1bp1B2KF50 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC30.43■■■□□ 2.46
Uhrf1bp1B2KF50 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC30.43■■■□□ 2.46
Uhrf1bp1B2KF50 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
Uhrf1bp1B2KF50 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Uhrf1bp1B2KF50 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Uhrf1bp1B2KF50 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Uhrf1bp1B2KF50 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC30.4■■■□□ 2.46
Uhrf1bp1B2KF50 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
Uhrf1bp1B2KF50 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
Uhrf1bp1B2KF50 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Uhrf1bp1B2KF50 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
Uhrf1bp1B2KF50 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
Uhrf1bp1B2KF50 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
Uhrf1bp1B2KF50 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC30.35■■■□□ 2.45
Uhrf1bp1B2KF50 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms