Protein–RNA interactions for Protein: B1ATG9

Trabd2b, Metalloprotease TIKI2, mousemouse

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trabd2bB1ATG9 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Trabd2bB1ATG9 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Trabd2bB1ATG9 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Trabd2bB1ATG9 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Trabd2bB1ATG9 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Trabd2bB1ATG9 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Trabd2bB1ATG9 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trabd2bB1ATG9 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trabd2bB1ATG9 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trabd2bB1ATG9 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trabd2bB1ATG9 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trabd2bB1ATG9 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trabd2bB1ATG9 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trabd2bB1ATG9 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Trabd2bB1ATG9 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Trabd2bB1ATG9 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Trabd2bB1ATG9 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trabd2bB1ATG9 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trabd2bB1ATG9 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trabd2bB1ATG9 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Trabd2bB1ATG9 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Trabd2bB1ATG9 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trabd2bB1ATG9 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trabd2bB1ATG9 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trabd2bB1ATG9 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trabd2bB1ATG9 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trabd2bB1ATG9 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Trabd2bB1ATG9 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Trabd2bB1ATG9 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Trabd2bB1ATG9 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Trabd2bB1ATG9 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Trabd2bB1ATG9 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Trabd2bB1ATG9 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Trabd2bB1ATG9 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Trabd2bB1ATG9 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Trabd2bB1ATG9 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Trabd2bB1ATG9 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Trabd2bB1ATG9 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Trabd2bB1ATG9 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Trabd2bB1ATG9 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Trabd2bB1ATG9 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trabd2bB1ATG9 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Trabd2bB1ATG9 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Trabd2bB1ATG9 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Trabd2bB1ATG9 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Trabd2bB1ATG9 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Trabd2bB1ATG9 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Trabd2bB1ATG9 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Trabd2bB1ATG9 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Trabd2bB1ATG9 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Trabd2bB1ATG9 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Trabd2bB1ATG9 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Trabd2bB1ATG9 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Trabd2bB1ATG9 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Trabd2bB1ATG9 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Trabd2bB1ATG9 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Trabd2bB1ATG9 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Trabd2bB1ATG9 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Trabd2bB1ATG9 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Trabd2bB1ATG9 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Trabd2bB1ATG9 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Trabd2bB1ATG9 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Trabd2bB1ATG9 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Trabd2bB1ATG9 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Trabd2bB1ATG9 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Trabd2bB1ATG9 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Trabd2bB1ATG9 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Trabd2bB1ATG9 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Trabd2bB1ATG9 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Trabd2bB1ATG9 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Trabd2bB1ATG9 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Trabd2bB1ATG9 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Trabd2bB1ATG9 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Trabd2bB1ATG9 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Trabd2bB1ATG9 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Trabd2bB1ATG9 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Trabd2bB1ATG9 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Trabd2bB1ATG9 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Trabd2bB1ATG9 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Trabd2bB1ATG9 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Trabd2bB1ATG9 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Trabd2bB1ATG9 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Trabd2bB1ATG9 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Trabd2bB1ATG9 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Trabd2bB1ATG9 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Trabd2bB1ATG9 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Trabd2bB1ATG9 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Trabd2bB1ATG9 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Trabd2bB1ATG9 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Trabd2bB1ATG9 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Trabd2bB1ATG9 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Trabd2bB1ATG9 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Trabd2bB1ATG9 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Trabd2bB1ATG9 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Trabd2bB1ATG9 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Trabd2bB1ATG9 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Trabd2bB1ATG9 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Trabd2bB1ATG9 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Trabd2bB1ATG9 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Trabd2bB1ATG9 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.9 ms