Protein–RNA interactions for Protein: B1AS29

Grik3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik3B1AS29 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,44■■□□□ 1,66
Grik3B1AS29 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25,43■■□□□ 1,66
Grik3B1AS29 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,43■■□□□ 1,66
Grik3B1AS29 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC25,42■■□□□ 1,66
Grik3B1AS29 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25,42■■□□□ 1,66
Grik3B1AS29 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,41■■□□□ 1,66
Grik3B1AS29 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25,4■■□□□ 1,66
Grik3B1AS29 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC25,4■■□□□ 1,66
Grik3B1AS29 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25,39■■□□□ 1,66
Grik3B1AS29 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,39■■□□□ 1,66
Grik3B1AS29 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,39■■□□□ 1,66
Grik3B1AS29 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25,38■■□□□ 1,65
Grik3B1AS29 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25,37■■□□□ 1,65
Grik3B1AS29 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC25,37■■□□□ 1,65
Grik3B1AS29 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC25,37■■□□□ 1,65
Grik3B1AS29 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,36■■□□□ 1,65
Grik3B1AS29 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC25,36■■□□□ 1,65
Grik3B1AS29 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,35■■□□□ 1,65
Grik3B1AS29 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC25,35■■□□□ 1,65
Grik3B1AS29 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC25,35■■□□□ 1,65
Grik3B1AS29 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC25,35■■□□□ 1,65
Grik3B1AS29 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,34■■□□□ 1,65
Grik3B1AS29 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,34■■□□□ 1,65
Grik3B1AS29 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,33■■□□□ 1,65
Grik3B1AS29 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,33■■□□□ 1,65
Grik3B1AS29 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,32■■□□□ 1,64
Grik3B1AS29 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25,32■■□□□ 1,64
Grik3B1AS29 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC25,32■■□□□ 1,64
Grik3B1AS29 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,32■■□□□ 1,64
Grik3B1AS29 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC25,31■■□□□ 1,64
Grik3B1AS29 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC25,31■■□□□ 1,64
Grik3B1AS29 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,31■■□□□ 1,64
Grik3B1AS29 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25,3■■□□□ 1,64
Grik3B1AS29 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25,3■■□□□ 1,64
Grik3B1AS29 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,3■■□□□ 1,64
Grik3B1AS29 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC25,29■■□□□ 1,64
Grik3B1AS29 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25,28■■□□□ 1,64
Grik3B1AS29 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC25,28■■□□□ 1,64
Grik3B1AS29 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC25,27■■□□□ 1,64
Grik3B1AS29 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,27■■□□□ 1,64
Grik3B1AS29 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC25,27■■□□□ 1,64
Grik3B1AS29 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,27■■□□□ 1,64
Grik3B1AS29 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC25,26■■□□□ 1,63
Grik3B1AS29 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,26■■□□□ 1,63
Grik3B1AS29 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25,25■■□□□ 1,63
Grik3B1AS29 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,25■■□□□ 1,63
Grik3B1AS29 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25,25■■□□□ 1,63
Grik3B1AS29 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,24■■□□□ 1,63
Grik3B1AS29 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC25,24■■□□□ 1,63
Grik3B1AS29 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC25,23■■□□□ 1,63
Grik3B1AS29 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC25,23■■□□□ 1,63
Grik3B1AS29 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC25,23■■□□□ 1,63
Grik3B1AS29 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC25,22■■□□□ 1,63
Grik3B1AS29 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC25,22■■□□□ 1,63
Grik3B1AS29 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,22■■□□□ 1,63
Grik3B1AS29 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25,22■■□□□ 1,63
Grik3B1AS29 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC25,21■■□□□ 1,63
Grik3B1AS29 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC25,21■■□□□ 1,63
Grik3B1AS29 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,21■■□□□ 1,63
Grik3B1AS29 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25,2■■□□□ 1,63
Grik3B1AS29 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC25,2■■□□□ 1,62
Grik3B1AS29 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,2■■□□□ 1,62
Grik3B1AS29 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,2■■□□□ 1,62
Grik3B1AS29 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25,19■■□□□ 1,62
Grik3B1AS29 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25,19■■□□□ 1,62
Grik3B1AS29 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC25,19■■□□□ 1,62
Grik3B1AS29 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25,19■■□□□ 1,62
Grik3B1AS29 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,19■■□□□ 1,62
Grik3B1AS29 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,18■■□□□ 1,62
Grik3B1AS29 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,18■■□□□ 1,62
Grik3B1AS29 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,17■■□□□ 1,62
Grik3B1AS29 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,17■■□□□ 1,62
Grik3B1AS29 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC25,16■■□□□ 1,62
Grik3B1AS29 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,16■■□□□ 1,62
Grik3B1AS29 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,16■■□□□ 1,62
Grik3B1AS29 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,14■■□□□ 1,62
Grik3B1AS29 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC25,13■■□□□ 1,61
Grik3B1AS29 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,13■■□□□ 1,61
Grik3B1AS29 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC25,12■■□□□ 1,61
Grik3B1AS29 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC25,12■■□□□ 1,61
Grik3B1AS29 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,12■■□□□ 1,61
Grik3B1AS29 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC25,11■■□□□ 1,61
Grik3B1AS29 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,11■■□□□ 1,61
Grik3B1AS29 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,11■■□□□ 1,61
Grik3B1AS29 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,11■■□□□ 1,61
Grik3B1AS29 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC25,1■■□□□ 1,61
Grik3B1AS29 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25,09■■□□□ 1,61
Grik3B1AS29 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,09■■□□□ 1,61
Grik3B1AS29 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC25,09■■□□□ 1,61
Grik3B1AS29 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,08■■□□□ 1,6
Grik3B1AS29 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,07■■□□□ 1,6
Grik3B1AS29 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,07■■□□□ 1,6
Grik3B1AS29 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25,06■■□□□ 1,6
Grik3B1AS29 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC25,06■■□□□ 1,6
Grik3B1AS29 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,06■■□□□ 1,6
Grik3B1AS29 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,06■■□□□ 1,6
Grik3B1AS29 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,06■■□□□ 1,6
Grik3B1AS29 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,06■■□□□ 1,6
Grik3B1AS29 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25,05■■□□□ 1,6
Grik3B1AS29 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,05■■□□□ 1,6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27,3 ms