Protein–RNA interactions for Protein: A9YVJ5

Gbp11, Guanylate binding protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp11A9YVJ5 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gbp11A9YVJ5 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gbp11A9YVJ5 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gbp11A9YVJ5 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gbp11A9YVJ5 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gbp11A9YVJ5 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gbp11A9YVJ5 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gbp11A9YVJ5 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Gbp11A9YVJ5 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gbp11A9YVJ5 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gbp11A9YVJ5 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gbp11A9YVJ5 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gbp11A9YVJ5 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gbp11A9YVJ5 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gbp11A9YVJ5 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gbp11A9YVJ5 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gbp11A9YVJ5 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gbp11A9YVJ5 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gbp11A9YVJ5 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gbp11A9YVJ5 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gbp11A9YVJ5 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gbp11A9YVJ5 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gbp11A9YVJ5 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Gbp11A9YVJ5 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gbp11A9YVJ5 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gbp11A9YVJ5 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gbp11A9YVJ5 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gbp11A9YVJ5 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gbp11A9YVJ5 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gbp11A9YVJ5 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gbp11A9YVJ5 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Gbp11A9YVJ5 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Gbp11A9YVJ5 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gbp11A9YVJ5 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gbp11A9YVJ5 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gbp11A9YVJ5 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gbp11A9YVJ5 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gbp11A9YVJ5 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gbp11A9YVJ5 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gbp11A9YVJ5 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Gbp11A9YVJ5 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gbp11A9YVJ5 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gbp11A9YVJ5 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gbp11A9YVJ5 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gbp11A9YVJ5 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gbp11A9YVJ5 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gbp11A9YVJ5 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gbp11A9YVJ5 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gbp11A9YVJ5 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gbp11A9YVJ5 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gbp11A9YVJ5 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gbp11A9YVJ5 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gbp11A9YVJ5 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gbp11A9YVJ5 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gbp11A9YVJ5 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gbp11A9YVJ5 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gbp11A9YVJ5 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gbp11A9YVJ5 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gbp11A9YVJ5 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gbp11A9YVJ5 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gbp11A9YVJ5 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gbp11A9YVJ5 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gbp11A9YVJ5 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gbp11A9YVJ5 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gbp11A9YVJ5 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gbp11A9YVJ5 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gbp11A9YVJ5 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gbp11A9YVJ5 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gbp11A9YVJ5 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gbp11A9YVJ5 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gbp11A9YVJ5 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gbp11A9YVJ5 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gbp11A9YVJ5 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gbp11A9YVJ5 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gbp11A9YVJ5 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gbp11A9YVJ5 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gbp11A9YVJ5 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gbp11A9YVJ5 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gbp11A9YVJ5 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gbp11A9YVJ5 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gbp11A9YVJ5 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gbp11A9YVJ5 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gbp11A9YVJ5 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gbp11A9YVJ5 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gbp11A9YVJ5 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Gbp11A9YVJ5 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gbp11A9YVJ5 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gbp11A9YVJ5 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Gbp11A9YVJ5 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Gbp11A9YVJ5 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gbp11A9YVJ5 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gbp11A9YVJ5 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gbp11A9YVJ5 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gbp11A9YVJ5 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gbp11A9YVJ5 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gbp11A9YVJ5 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gbp11A9YVJ5 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gbp11A9YVJ5 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gbp11A9YVJ5 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gbp11A9YVJ5 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.1 ms