Protein–RNA interactions for Protein: A6NAS3

Gm3173, Alpha6-takusan, mousemouse

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3173A6NAS3 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Gm3173A6NAS3 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Gm3173A6NAS3 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Gm3173A6NAS3 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Gm3173A6NAS3 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Gm3173A6NAS3 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.39
Gm3173A6NAS3 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Gm3173A6NAS3 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Gm3173A6NAS3 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Gm3173A6NAS3 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Gm3173A6NAS3 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Gm3173A6NAS3 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Gm3173A6NAS3 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Gm3173A6NAS3 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Gm3173A6NAS3 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Gm3173A6NAS3 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Gm3173A6NAS3 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Gm3173A6NAS3 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Gm3173A6NAS3 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Gm3173A6NAS3 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Gm3173A6NAS3 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Gm3173A6NAS3 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Gm3173A6NAS3 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Gm3173A6NAS3 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Gm3173A6NAS3 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Gm3173A6NAS3 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Gm3173A6NAS3 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Gm3173A6NAS3 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Gm3173A6NAS3 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Gm3173A6NAS3 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Gm3173A6NAS3 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Gm3173A6NAS3 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Gm3173A6NAS3 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Gm3173A6NAS3 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Gm3173A6NAS3 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Gm3173A6NAS3 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Gm3173A6NAS3 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Gm3173A6NAS3 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Gm3173A6NAS3 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Gm3173A6NAS3 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Gm3173A6NAS3 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Gm3173A6NAS3 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Gm3173A6NAS3 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Gm3173A6NAS3 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Gm3173A6NAS3 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Gm3173A6NAS3 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Gm3173A6NAS3 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Gm3173A6NAS3 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Gm3173A6NAS3 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Gm3173A6NAS3 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Gm3173A6NAS3 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Gm3173A6NAS3 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Gm3173A6NAS3 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Gm3173A6NAS3 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Gm3173A6NAS3 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Gm3173A6NAS3 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Gm3173A6NAS3 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Gm3173A6NAS3 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Gm3173A6NAS3 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Gm3173A6NAS3 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Gm3173A6NAS3 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Gm3173A6NAS3 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Gm3173A6NAS3 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gm3173A6NAS3 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gm3173A6NAS3 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gm3173A6NAS3 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gm3173A6NAS3 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gm3173A6NAS3 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gm3173A6NAS3 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gm3173A6NAS3 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gm3173A6NAS3 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gm3173A6NAS3 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Gm3173A6NAS3 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Gm3173A6NAS3 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Gm3173A6NAS3 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Gm3173A6NAS3 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Gm3173A6NAS3 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Gm3173A6NAS3 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gm3173A6NAS3 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gm3173A6NAS3 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gm3173A6NAS3 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gm3173A6NAS3 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Gm3173A6NAS3 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gm3173A6NAS3 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gm3173A6NAS3 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gm3173A6NAS3 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gm3173A6NAS3 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gm3173A6NAS3 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Gm3173A6NAS3 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gm3173A6NAS3 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Gm3173A6NAS3 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gm3173A6NAS3 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gm3173A6NAS3 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gm3173A6NAS3 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gm3173A6NAS3 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Gm3173A6NAS3 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gm3173A6NAS3 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gm3173A6NAS3 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gm3173A6NAS3 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gm3173A6NAS3 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 147.5 ms