Protein–RNA interactions for Protein: A6H6E9

Ttc23l, Tetratricopeptide repeat protein 23-like, mousemouse

Predictions only

Length 458 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc23lA6H6E9 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ttc23lA6H6E9 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ttc23lA6H6E9 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ttc23lA6H6E9 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ttc23lA6H6E9 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ttc23lA6H6E9 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ttc23lA6H6E9 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ttc23lA6H6E9 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ttc23lA6H6E9 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ttc23lA6H6E9 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ttc23lA6H6E9 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ttc23lA6H6E9 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ttc23lA6H6E9 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ttc23lA6H6E9 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ttc23lA6H6E9 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ttc23lA6H6E9 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ttc23lA6H6E9 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ttc23lA6H6E9 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ttc23lA6H6E9 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ttc23lA6H6E9 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ttc23lA6H6E9 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ttc23lA6H6E9 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ttc23lA6H6E9 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ttc23lA6H6E9 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ttc23lA6H6E9 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ttc23lA6H6E9 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ttc23lA6H6E9 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ttc23lA6H6E9 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ttc23lA6H6E9 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ttc23lA6H6E9 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ttc23lA6H6E9 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ttc23lA6H6E9 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ttc23lA6H6E9 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ttc23lA6H6E9 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ttc23lA6H6E9 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ttc23lA6H6E9 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ttc23lA6H6E9 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ttc23lA6H6E9 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ttc23lA6H6E9 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ttc23lA6H6E9 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ttc23lA6H6E9 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ttc23lA6H6E9 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ttc23lA6H6E9 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ttc23lA6H6E9 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ttc23lA6H6E9 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ttc23lA6H6E9 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ttc23lA6H6E9 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ttc23lA6H6E9 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ttc23lA6H6E9 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ttc23lA6H6E9 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Ttc23lA6H6E9 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ttc23lA6H6E9 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ttc23lA6H6E9 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ttc23lA6H6E9 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ttc23lA6H6E9 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Ttc23lA6H6E9 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ttc23lA6H6E9 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ttc23lA6H6E9 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ttc23lA6H6E9 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ttc23lA6H6E9 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ttc23lA6H6E9 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ttc23lA6H6E9 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ttc23lA6H6E9 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ttc23lA6H6E9 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ttc23lA6H6E9 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ttc23lA6H6E9 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ttc23lA6H6E9 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ttc23lA6H6E9 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Ttc23lA6H6E9 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ttc23lA6H6E9 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ttc23lA6H6E9 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ttc23lA6H6E9 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Ttc23lA6H6E9 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ttc23lA6H6E9 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ttc23lA6H6E9 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Ttc23lA6H6E9 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ttc23lA6H6E9 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ttc23lA6H6E9 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ttc23lA6H6E9 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Ttc23lA6H6E9 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ttc23lA6H6E9 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Ttc23lA6H6E9 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Ttc23lA6H6E9 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ttc23lA6H6E9 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ttc23lA6H6E9 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ttc23lA6H6E9 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ttc23lA6H6E9 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ttc23lA6H6E9 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ttc23lA6H6E9 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ttc23lA6H6E9 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ttc23lA6H6E9 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ttc23lA6H6E9 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ttc23lA6H6E9 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ttc23lA6H6E9 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ttc23lA6H6E9 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ttc23lA6H6E9 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ttc23lA6H6E9 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ttc23lA6H6E9 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ttc23lA6H6E9 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ttc23lA6H6E9 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.7 ms