Protein–RNA interactions for Protein: A2ASQ1

Agrn, Agrin, mousemouse

Predictions only

Length 1,950 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AgrnA2ASQ1 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
AgrnA2ASQ1 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
AgrnA2ASQ1 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
AgrnA2ASQ1 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
AgrnA2ASQ1 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
AgrnA2ASQ1 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
AgrnA2ASQ1 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
AgrnA2ASQ1 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
AgrnA2ASQ1 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
AgrnA2ASQ1 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
AgrnA2ASQ1 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
AgrnA2ASQ1 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
AgrnA2ASQ1 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
AgrnA2ASQ1 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
AgrnA2ASQ1 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
AgrnA2ASQ1 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
AgrnA2ASQ1 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
AgrnA2ASQ1 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
AgrnA2ASQ1 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
AgrnA2ASQ1 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
AgrnA2ASQ1 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
AgrnA2ASQ1 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
AgrnA2ASQ1 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
AgrnA2ASQ1 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
AgrnA2ASQ1 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
AgrnA2ASQ1 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
AgrnA2ASQ1 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
AgrnA2ASQ1 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
AgrnA2ASQ1 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
AgrnA2ASQ1 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
AgrnA2ASQ1 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
AgrnA2ASQ1 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
AgrnA2ASQ1 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
AgrnA2ASQ1 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
AgrnA2ASQ1 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
AgrnA2ASQ1 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
AgrnA2ASQ1 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
AgrnA2ASQ1 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
AgrnA2ASQ1 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
AgrnA2ASQ1 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
AgrnA2ASQ1 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
AgrnA2ASQ1 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
AgrnA2ASQ1 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
AgrnA2ASQ1 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
AgrnA2ASQ1 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
AgrnA2ASQ1 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
AgrnA2ASQ1 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
AgrnA2ASQ1 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
AgrnA2ASQ1 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
AgrnA2ASQ1 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
AgrnA2ASQ1 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
AgrnA2ASQ1 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
AgrnA2ASQ1 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
AgrnA2ASQ1 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
AgrnA2ASQ1 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
AgrnA2ASQ1 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
AgrnA2ASQ1 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
AgrnA2ASQ1 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
AgrnA2ASQ1 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
AgrnA2ASQ1 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
AgrnA2ASQ1 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
AgrnA2ASQ1 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
AgrnA2ASQ1 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
AgrnA2ASQ1 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
AgrnA2ASQ1 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
AgrnA2ASQ1 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
AgrnA2ASQ1 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
AgrnA2ASQ1 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
AgrnA2ASQ1 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
AgrnA2ASQ1 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
AgrnA2ASQ1 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
AgrnA2ASQ1 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
AgrnA2ASQ1 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
AgrnA2ASQ1 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
AgrnA2ASQ1 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
AgrnA2ASQ1 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
AgrnA2ASQ1 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
AgrnA2ASQ1 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
AgrnA2ASQ1 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
AgrnA2ASQ1 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
AgrnA2ASQ1 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
AgrnA2ASQ1 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
AgrnA2ASQ1 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
AgrnA2ASQ1 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
AgrnA2ASQ1 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
AgrnA2ASQ1 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
AgrnA2ASQ1 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
AgrnA2ASQ1 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
AgrnA2ASQ1 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
AgrnA2ASQ1 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
AgrnA2ASQ1 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
AgrnA2ASQ1 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
AgrnA2ASQ1 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
AgrnA2ASQ1 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
AgrnA2ASQ1 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
AgrnA2ASQ1 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
AgrnA2ASQ1 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
AgrnA2ASQ1 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
AgrnA2ASQ1 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
AgrnA2ASQ1 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
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