Protein–RNA interactions for Protein: A2ANA3

Cldn34c4, Claudin 34C4, mousemouse

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34c4A2ANA3 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cldn34c4A2ANA3 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cldn34c4A2ANA3 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cldn34c4A2ANA3 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cldn34c4A2ANA3 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cldn34c4A2ANA3 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cldn34c4A2ANA3 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cldn34c4A2ANA3 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cldn34c4A2ANA3 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cldn34c4A2ANA3 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Cldn34c4A2ANA3 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Cldn34c4A2ANA3 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cldn34c4A2ANA3 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cldn34c4A2ANA3 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cldn34c4A2ANA3 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cldn34c4A2ANA3 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cldn34c4A2ANA3 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cldn34c4A2ANA3 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cldn34c4A2ANA3 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cldn34c4A2ANA3 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cldn34c4A2ANA3 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Cldn34c4A2ANA3 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cldn34c4A2ANA3 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cldn34c4A2ANA3 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cldn34c4A2ANA3 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cldn34c4A2ANA3 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cldn34c4A2ANA3 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cldn34c4A2ANA3 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cldn34c4A2ANA3 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Cldn34c4A2ANA3 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cldn34c4A2ANA3 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cldn34c4A2ANA3 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cldn34c4A2ANA3 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cldn34c4A2ANA3 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cldn34c4A2ANA3 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cldn34c4A2ANA3 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cldn34c4A2ANA3 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cldn34c4A2ANA3 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cldn34c4A2ANA3 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cldn34c4A2ANA3 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cldn34c4A2ANA3 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cldn34c4A2ANA3 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cldn34c4A2ANA3 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cldn34c4A2ANA3 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cldn34c4A2ANA3 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cldn34c4A2ANA3 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cldn34c4A2ANA3 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cldn34c4A2ANA3 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cldn34c4A2ANA3 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cldn34c4A2ANA3 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cldn34c4A2ANA3 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cldn34c4A2ANA3 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cldn34c4A2ANA3 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cldn34c4A2ANA3 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cldn34c4A2ANA3 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cldn34c4A2ANA3 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cldn34c4A2ANA3 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cldn34c4A2ANA3 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cldn34c4A2ANA3 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cldn34c4A2ANA3 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cldn34c4A2ANA3 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Cldn34c4A2ANA3 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cldn34c4A2ANA3 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cldn34c4A2ANA3 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cldn34c4A2ANA3 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cldn34c4A2ANA3 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cldn34c4A2ANA3 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cldn34c4A2ANA3 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cldn34c4A2ANA3 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cldn34c4A2ANA3 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cldn34c4A2ANA3 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cldn34c4A2ANA3 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cldn34c4A2ANA3 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cldn34c4A2ANA3 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cldn34c4A2ANA3 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cldn34c4A2ANA3 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cldn34c4A2ANA3 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cldn34c4A2ANA3 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Cldn34c4A2ANA3 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Cldn34c4A2ANA3 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Cldn34c4A2ANA3 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cldn34c4A2ANA3 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cldn34c4A2ANA3 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cldn34c4A2ANA3 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cldn34c4A2ANA3 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cldn34c4A2ANA3 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cldn34c4A2ANA3 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cldn34c4A2ANA3 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Cldn34c4A2ANA3 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cldn34c4A2ANA3 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cldn34c4A2ANA3 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cldn34c4A2ANA3 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cldn34c4A2ANA3 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cldn34c4A2ANA3 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Cldn34c4A2ANA3 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cldn34c4A2ANA3 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cldn34c4A2ANA3 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cldn34c4A2ANA3 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cldn34c4A2ANA3 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Cldn34c4A2ANA3 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms