Protein–RNA interactions for Protein: A2AKM2

Hacd4, Very-long-chain (3R)-3-hydroxyacyl-CoA dehydratase 4, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hacd4A2AKM2 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Hacd4A2AKM2 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Hacd4A2AKM2 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Hacd4A2AKM2 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Hacd4A2AKM2 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Hacd4A2AKM2 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Hacd4A2AKM2 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Hacd4A2AKM2 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Hacd4A2AKM2 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Hacd4A2AKM2 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Hacd4A2AKM2 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Hacd4A2AKM2 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Hacd4A2AKM2 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Hacd4A2AKM2 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Hacd4A2AKM2 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Hacd4A2AKM2 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Hacd4A2AKM2 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Hacd4A2AKM2 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Hacd4A2AKM2 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Hacd4A2AKM2 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Hacd4A2AKM2 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Hacd4A2AKM2 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Hacd4A2AKM2 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Hacd4A2AKM2 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Hacd4A2AKM2 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Hacd4A2AKM2 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Hacd4A2AKM2 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Hacd4A2AKM2 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Hacd4A2AKM2 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Hacd4A2AKM2 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Hacd4A2AKM2 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Hacd4A2AKM2 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Hacd4A2AKM2 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Hacd4A2AKM2 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Hacd4A2AKM2 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Hacd4A2AKM2 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Hacd4A2AKM2 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Hacd4A2AKM2 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Hacd4A2AKM2 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Hacd4A2AKM2 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Hacd4A2AKM2 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Hacd4A2AKM2 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Hacd4A2AKM2 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Hacd4A2AKM2 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Hacd4A2AKM2 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Hacd4A2AKM2 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Hacd4A2AKM2 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Hacd4A2AKM2 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Hacd4A2AKM2 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Hacd4A2AKM2 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Hacd4A2AKM2 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Hacd4A2AKM2 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Hacd4A2AKM2 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Hacd4A2AKM2 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Hacd4A2AKM2 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Hacd4A2AKM2 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Hacd4A2AKM2 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Hacd4A2AKM2 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Hacd4A2AKM2 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Hacd4A2AKM2 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Hacd4A2AKM2 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Hacd4A2AKM2 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Hacd4A2AKM2 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Hacd4A2AKM2 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Hacd4A2AKM2 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Hacd4A2AKM2 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Hacd4A2AKM2 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Hacd4A2AKM2 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Hacd4A2AKM2 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
Hacd4A2AKM2 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Hacd4A2AKM2 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Hacd4A2AKM2 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Hacd4A2AKM2 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Hacd4A2AKM2 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Hacd4A2AKM2 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Hacd4A2AKM2 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Hacd4A2AKM2 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Hacd4A2AKM2 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Hacd4A2AKM2 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Hacd4A2AKM2 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hacd4A2AKM2 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hacd4A2AKM2 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hacd4A2AKM2 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hacd4A2AKM2 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Hacd4A2AKM2 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Hacd4A2AKM2 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Hacd4A2AKM2 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Hacd4A2AKM2 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Hacd4A2AKM2 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Hacd4A2AKM2 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Hacd4A2AKM2 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Hacd4A2AKM2 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hacd4A2AKM2 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hacd4A2AKM2 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hacd4A2AKM2 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hacd4A2AKM2 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hacd4A2AKM2 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hacd4A2AKM2 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hacd4A2AKM2 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hacd4A2AKM2 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms