Protein–RNA interactions for Protein: A2AJA7

Mamdc4, Apical endosomal glycoprotein, mousemouse

Predictions only

Length 1,228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mamdc4A2AJA7 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Mamdc4A2AJA7 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Mamdc4A2AJA7 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Mamdc4A2AJA7 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Mamdc4A2AJA7 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Mamdc4A2AJA7 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Mamdc4A2AJA7 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Mamdc4A2AJA7 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Mamdc4A2AJA7 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Mamdc4A2AJA7 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Mamdc4A2AJA7 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Mamdc4A2AJA7 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Mamdc4A2AJA7 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Mamdc4A2AJA7 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Mamdc4A2AJA7 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Mamdc4A2AJA7 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Mamdc4A2AJA7 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Mamdc4A2AJA7 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Mamdc4A2AJA7 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Mamdc4A2AJA7 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Mamdc4A2AJA7 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Mamdc4A2AJA7 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Mamdc4A2AJA7 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Mamdc4A2AJA7 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Mamdc4A2AJA7 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Mamdc4A2AJA7 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Mamdc4A2AJA7 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Mamdc4A2AJA7 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Mamdc4A2AJA7 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Mamdc4A2AJA7 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Mamdc4A2AJA7 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Mamdc4A2AJA7 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Mamdc4A2AJA7 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Mamdc4A2AJA7 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Mamdc4A2AJA7 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Mamdc4A2AJA7 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Mamdc4A2AJA7 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Mamdc4A2AJA7 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Mamdc4A2AJA7 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Mamdc4A2AJA7 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Mamdc4A2AJA7 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Mamdc4A2AJA7 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Mamdc4A2AJA7 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Mamdc4A2AJA7 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Mamdc4A2AJA7 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Mamdc4A2AJA7 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Mamdc4A2AJA7 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Mamdc4A2AJA7 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Mamdc4A2AJA7 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Mamdc4A2AJA7 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Mamdc4A2AJA7 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Mamdc4A2AJA7 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Mamdc4A2AJA7 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Mamdc4A2AJA7 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Mamdc4A2AJA7 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Mamdc4A2AJA7 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Mamdc4A2AJA7 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Mamdc4A2AJA7 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Mamdc4A2AJA7 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Mamdc4A2AJA7 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Mamdc4A2AJA7 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Mamdc4A2AJA7 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Mamdc4A2AJA7 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Mamdc4A2AJA7 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Mamdc4A2AJA7 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Mamdc4A2AJA7 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Mamdc4A2AJA7 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Mamdc4A2AJA7 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Mamdc4A2AJA7 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Mamdc4A2AJA7 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Mamdc4A2AJA7 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Mamdc4A2AJA7 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Mamdc4A2AJA7 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Mamdc4A2AJA7 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Mamdc4A2AJA7 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Mamdc4A2AJA7 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Mamdc4A2AJA7 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Mamdc4A2AJA7 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Mamdc4A2AJA7 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Mamdc4A2AJA7 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Mamdc4A2AJA7 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Mamdc4A2AJA7 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Mamdc4A2AJA7 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Mamdc4A2AJA7 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Mamdc4A2AJA7 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Mamdc4A2AJA7 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Mamdc4A2AJA7 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Mamdc4A2AJA7 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Mamdc4A2AJA7 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Mamdc4A2AJA7 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Mamdc4A2AJA7 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Mamdc4A2AJA7 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Mamdc4A2AJA7 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Mamdc4A2AJA7 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Mamdc4A2AJA7 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Mamdc4A2AJA7 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Mamdc4A2AJA7 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Mamdc4A2AJA7 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Mamdc4A2AJA7 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Mamdc4A2AJA7 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.4 ms