Protein–RNA interactions for Protein: A2A5Z6

Smurf2, E3 ubiquitin-protein ligase SMURF2, mousemouse

Predictions only

Length 748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smurf2A2A5Z6 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Smurf2A2A5Z6 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Smurf2A2A5Z6 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Smurf2A2A5Z6 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Smurf2A2A5Z6 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Smurf2A2A5Z6 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Smurf2A2A5Z6 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Smurf2A2A5Z6 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Smurf2A2A5Z6 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Smurf2A2A5Z6 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Smurf2A2A5Z6 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Smurf2A2A5Z6 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Smurf2A2A5Z6 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Smurf2A2A5Z6 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Smurf2A2A5Z6 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Smurf2A2A5Z6 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Smurf2A2A5Z6 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Smurf2A2A5Z6 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Smurf2A2A5Z6 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Smurf2A2A5Z6 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Smurf2A2A5Z6 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Smurf2A2A5Z6 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Smurf2A2A5Z6 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Smurf2A2A5Z6 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Smurf2A2A5Z6 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Smurf2A2A5Z6 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Smurf2A2A5Z6 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Smurf2A2A5Z6 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Smurf2A2A5Z6 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Smurf2A2A5Z6 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Smurf2A2A5Z6 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Smurf2A2A5Z6 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Smurf2A2A5Z6 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Smurf2A2A5Z6 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Smurf2A2A5Z6 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Smurf2A2A5Z6 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Smurf2A2A5Z6 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Smurf2A2A5Z6 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Smurf2A2A5Z6 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Smurf2A2A5Z6 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Smurf2A2A5Z6 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Smurf2A2A5Z6 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Smurf2A2A5Z6 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Smurf2A2A5Z6 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Smurf2A2A5Z6 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Smurf2A2A5Z6 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Smurf2A2A5Z6 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Smurf2A2A5Z6 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Smurf2A2A5Z6 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Smurf2A2A5Z6 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Smurf2A2A5Z6 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Smurf2A2A5Z6 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Smurf2A2A5Z6 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Smurf2A2A5Z6 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Smurf2A2A5Z6 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Smurf2A2A5Z6 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Smurf2A2A5Z6 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Smurf2A2A5Z6 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Smurf2A2A5Z6 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Smurf2A2A5Z6 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Smurf2A2A5Z6 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Smurf2A2A5Z6 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Smurf2A2A5Z6 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Smurf2A2A5Z6 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Smurf2A2A5Z6 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Smurf2A2A5Z6 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Smurf2A2A5Z6 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Smurf2A2A5Z6 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Smurf2A2A5Z6 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Smurf2A2A5Z6 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Smurf2A2A5Z6 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Smurf2A2A5Z6 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Smurf2A2A5Z6 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Smurf2A2A5Z6 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Smurf2A2A5Z6 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Smurf2A2A5Z6 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Smurf2A2A5Z6 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Smurf2A2A5Z6 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Smurf2A2A5Z6 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Smurf2A2A5Z6 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Smurf2A2A5Z6 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Smurf2A2A5Z6 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Smurf2A2A5Z6 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Smurf2A2A5Z6 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Smurf2A2A5Z6 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Smurf2A2A5Z6 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Smurf2A2A5Z6 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Smurf2A2A5Z6 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Smurf2A2A5Z6 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Smurf2A2A5Z6 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Smurf2A2A5Z6 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Smurf2A2A5Z6 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Smurf2A2A5Z6 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Smurf2A2A5Z6 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Smurf2A2A5Z6 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Smurf2A2A5Z6 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Smurf2A2A5Z6 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Smurf2A2A5Z6 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Smurf2A2A5Z6 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Smurf2A2A5Z6 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.2 ms