Protein–RNA interactions for Protein: A0A0N4SVU1

Gm7298, Predicted gene 7298, mousemouse

Predictions only

Length 1,476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm7298A0A0N4SVU1 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC37.79■■■■□ 3.64
Gm7298A0A0N4SVU1 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC37.78■■■■□ 3.64
Gm7298A0A0N4SVU1 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.77■■■■□ 3.64
Gm7298A0A0N4SVU1 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.76■■■■□ 3.63
Gm7298A0A0N4SVU1 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC37.75■■■■□ 3.63
Gm7298A0A0N4SVU1 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.75■■■■□ 3.63
Gm7298A0A0N4SVU1 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.74■■■■□ 3.63
Gm7298A0A0N4SVU1 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC37.74■■■■□ 3.63
Gm7298A0A0N4SVU1 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.73■■■■□ 3.63
Gm7298A0A0N4SVU1 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC37.72■■■■□ 3.63
Gm7298A0A0N4SVU1 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.71■■■■□ 3.63
Gm7298A0A0N4SVU1 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC37.71■■■■□ 3.63
Gm7298A0A0N4SVU1 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC37.71■■■■□ 3.63
Gm7298A0A0N4SVU1 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.71■■■■□ 3.63
Gm7298A0A0N4SVU1 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.71■■■■□ 3.63
Gm7298A0A0N4SVU1 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.71■■■■□ 3.63
Gm7298A0A0N4SVU1 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.71■■■■□ 3.63
Gm7298A0A0N4SVU1 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.7■■■■□ 3.63
Gm7298A0A0N4SVU1 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC37.7■■■■□ 3.63
Gm7298A0A0N4SVU1 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.7■■■■□ 3.63
Gm7298A0A0N4SVU1 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.69■■■■□ 3.62
Gm7298A0A0N4SVU1 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.68■■■■□ 3.62
Gm7298A0A0N4SVU1 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.68■■■■□ 3.62
Gm7298A0A0N4SVU1 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC37.67■■■■□ 3.62
Gm7298A0A0N4SVU1 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC37.66■■■■□ 3.62
Gm7298A0A0N4SVU1 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.66■■■■□ 3.62
Gm7298A0A0N4SVU1 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC37.65■■■■□ 3.62
Gm7298A0A0N4SVU1 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC37.63■■■■□ 3.62
Gm7298A0A0N4SVU1 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC37.62■■■■□ 3.61
Gm7298A0A0N4SVU1 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC37.62■■■■□ 3.61
Gm7298A0A0N4SVU1 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.62■■■■□ 3.61
Gm7298A0A0N4SVU1 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
Gm7298A0A0N4SVU1 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC37.59■■■■□ 3.61
Gm7298A0A0N4SVU1 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC37.58■■■■□ 3.61
Gm7298A0A0N4SVU1 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC37.57■■■■□ 3.6
Gm7298A0A0N4SVU1 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.57■■■■□ 3.6
Gm7298A0A0N4SVU1 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.56■■■■□ 3.6
Gm7298A0A0N4SVU1 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC37.56■■■■□ 3.6
Gm7298A0A0N4SVU1 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC37.56■■■■□ 3.6
Gm7298A0A0N4SVU1 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC37.55■■■■□ 3.6
Gm7298A0A0N4SVU1 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC37.54■■■■□ 3.6
Gm7298A0A0N4SVU1 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC37.54■■■■□ 3.6
Gm7298A0A0N4SVU1 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.54■■■■□ 3.6
Gm7298A0A0N4SVU1 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC37.53■■■■□ 3.6
Gm7298A0A0N4SVU1 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
Gm7298A0A0N4SVU1 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
Gm7298A0A0N4SVU1 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.51■■■■□ 3.59
Gm7298A0A0N4SVU1 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.51■■■■□ 3.59
Gm7298A0A0N4SVU1 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC37.5■■■■□ 3.59
Gm7298A0A0N4SVU1 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
Gm7298A0A0N4SVU1 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.49■■■■□ 3.59
Gm7298A0A0N4SVU1 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC37.49■■■■□ 3.59
Gm7298A0A0N4SVU1 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC37.48■■■■□ 3.59
Gm7298A0A0N4SVU1 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.48■■■■□ 3.59
Gm7298A0A0N4SVU1 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.47■■■■□ 3.59
Gm7298A0A0N4SVU1 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC37.47■■■■□ 3.59
Gm7298A0A0N4SVU1 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.46■■■■□ 3.59
Gm7298A0A0N4SVU1 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC37.45■■■■□ 3.59
Gm7298A0A0N4SVU1 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.45■■■■□ 3.59
Gm7298A0A0N4SVU1 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.44■■■■□ 3.58
Gm7298A0A0N4SVU1 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC37.43■■■■□ 3.58
Gm7298A0A0N4SVU1 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.43■■■■□ 3.58
Gm7298A0A0N4SVU1 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC37.43■■■■□ 3.58
Gm7298A0A0N4SVU1 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC37.43■■■■□ 3.58
Gm7298A0A0N4SVU1 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.42■■■■□ 3.58
Gm7298A0A0N4SVU1 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC37.42■■■■□ 3.58
Gm7298A0A0N4SVU1 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.42■■■■□ 3.58
Gm7298A0A0N4SVU1 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC37.41■■■■□ 3.58
Gm7298A0A0N4SVU1 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC37.4■■■■□ 3.58
Gm7298A0A0N4SVU1 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC37.4■■■■□ 3.58
Gm7298A0A0N4SVU1 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.39■■■■□ 3.58
Gm7298A0A0N4SVU1 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.39■■■■□ 3.58
Gm7298A0A0N4SVU1 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC37.39■■■■□ 3.58
Gm7298A0A0N4SVU1 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.38■■■■□ 3.58
Gm7298A0A0N4SVU1 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.38■■■■□ 3.57
Gm7298A0A0N4SVU1 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC37.38■■■■□ 3.57
Gm7298A0A0N4SVU1 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC37.38■■■■□ 3.57
Gm7298A0A0N4SVU1 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC37.38■■■■□ 3.57
Gm7298A0A0N4SVU1 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC37.37■■■■□ 3.57
Gm7298A0A0N4SVU1 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC37.37■■■■□ 3.57
Gm7298A0A0N4SVU1 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.36■■■■□ 3.57
Gm7298A0A0N4SVU1 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.36■■■■□ 3.57
Gm7298A0A0N4SVU1 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC37.36■■■■□ 3.57
Gm7298A0A0N4SVU1 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.36■■■■□ 3.57
Gm7298A0A0N4SVU1 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
Gm7298A0A0N4SVU1 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
Gm7298A0A0N4SVU1 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
Gm7298A0A0N4SVU1 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.57
Gm7298A0A0N4SVU1 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.56
Gm7298A0A0N4SVU1 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.31■■■■□ 3.56
Gm7298A0A0N4SVU1 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC37.3■■■■□ 3.56
Gm7298A0A0N4SVU1 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.3■■■■□ 3.56
Gm7298A0A0N4SVU1 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
Gm7298A0A0N4SVU1 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
Gm7298A0A0N4SVU1 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.27■■■■□ 3.56
Gm7298A0A0N4SVU1 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.55
Gm7298A0A0N4SVU1 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
Gm7298A0A0N4SVU1 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC37.25■■■■□ 3.55
Gm7298A0A0N4SVU1 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
Gm7298A0A0N4SVU1 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.2 ms